RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365375.1

RNU6-728P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 728, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-728P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-728P-201ENST00000365375 MKRN2OSH3BPM6 223 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 TSNQ15631 228 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF56Q15929 161 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 COQ5Q5HYK3 327 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 KLK6Q92876 244 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 DIRAS2Q96HU8 199 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 BIRC6Q9NR09 4857 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 SOGA1O94964 1423 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 A0A1W2PRS3 328 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 E7EUB6 86 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR2J2O76002 312 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 CXCL8P10145 99 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 SPAG11BQ08648 103 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 PPP1R1AQ13522 171 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 DEFB109BQ30KR1 87 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 FBXO48Q5FWF7 155 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 LPCAT3Q6P1A2 487 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 C4orf22Q6V702 233 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 IDO2Q6ZQW0 420 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 CD302Q8IX05 232 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 GDPD1Q8N9F7 314 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 NAT14Q8WUY8 206 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 TOMM6Q96B49 74 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 MALSU1Q96EH3 234 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 DHRS9Q9BPW9 319 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 GGACTQ9BVM4 153 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 FBXL12Q9NXK8 326 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 MUC17Q685J3 4493 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 SPTA1P02549 2419 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 HECW2Q9P2P5 1572 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 ERC2-IT1O76042 136 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 IFNA10P01566 189 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 TYMSP04818 313 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 MARCKSL1P49006 195 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 RSU1Q15404 277 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 BATFQ16520 125 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 SLC51BQ86UW2 128 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 BOD1L2Q8IYS8 172 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR5D14Q8NGL3 314 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 CANT1Q8WVQ1 401 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 LINC00208Q96KT6 92 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 FAM96AQ9H5X1 160 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 A0A087WSZ3 146 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 DPRXA6NFQ7 191 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 BIRC5O15392 142 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 RD3LP0DJH9 198 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 CD79AP11912 226 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR2T10Q8NGZ9 312 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 WFDC5Q8TCV5 224 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 SLAMF6Q96DU3 332 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 SMIM19Q96E16 107 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 MSANTD3Q96H12 275 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-728P-201ENST00000365375 PIRO00625 290 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 PPIBP23284 216 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 DYNLT1P63172 113 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 XAF1Q6GPH4 301 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 COPS6Q7L5N1 327 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 C10orf111Q8N326 155 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR10AG1Q8NH19 301 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 Q96NJ1 140 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 NINQ8N4C6 2090 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 NUP98P52948 1817 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 ITPR3Q14573 2671 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 CHD8Q9HCK8 2581 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 NEO1Q92859 1461 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 A6NN06 94 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 SMLR1H3BR10 107 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 NDUFS8O00217 210 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 UGT2B7P16662 529 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 PDE6GP18545 87 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 CARD18P57730 90 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 ALKAL1Q6UXT8 129 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 COMMD7Q86VX2 200 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR5AS1Q8N127 324 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 PBOV1Q9GZY1 135 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 LAMB1P07942 1786 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 FAT3Q8TDW7 4589 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 A0A087X0T9 212 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-728P-201ENST00000365375 A0A096LNT2 108 aa-1.5□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms