RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 OR51M1Q9H341 326 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.9□□□□□ -1.14
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RABGGTB-201ENST00000319942 CENPEQ02224 2701 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGGTB-201ENST00000319942 TRGV3P03979 118 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC3BP05452 202 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 CTSGP08311 255 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 HNF1AP20823 631 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 CD81P60033 236 aa7.89□□□□□ -1.15
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RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
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RABGGTB-201ENST00000319942 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
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RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.88□□□□□ -1.15
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RABGGTB-201ENST00000319942 CD5LO43866 347 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 SCO1O75880 301 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2C1O95371 312 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 BTN1A1Q13410 526 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF125Q96EQ8 232 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 TVP23CQ96ET8 276 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 S4R3C0 116 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM74A7A6NL05 159 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 IL4P05112 153 aa7.87□□□□□ -1.15
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RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM86BQ8N661 226 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.87□□□□□ -1.15
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RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00310P59036 64 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 TPPP2P59282 170 aa7.87□□□□□ -1.15
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RABGGTB-201ENST00000319942 FAM209BQ5JX69 171 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF503Q96F45 646 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.87□□□□□ -1.15
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RABGGTB-201ENST00000319942 PF4V1P10720 104 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35B1P78383 322 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGGTB-201ENST00000319942 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 GNB4Q9HAV0 340 aa7.86□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 TGOLN2O43493 480 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 AWAT1Q58HT5 328 aa7.85□□□□□ -1.15
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