RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258796.11

TTYH3-201, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTYH3, Length 4,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-201ENST00000258796 NPIPB5A8MRT5 1133 aa16.16■□□□□ 0.18
TTYH3-201ENST00000258796 SMAGPQ0VAQ4 97 aa16.16■□□□□ 0.18
TTYH3-201ENST00000258796 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TTYH3-201ENST00000258796 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa16.16■□□□□ 0.18
TTYH3-201ENST00000258796 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa16.15■□□□□ 0.18
TTYH3-201ENST00000258796 FAM71F2Q6NXP2 309 aa16.15■□□□□ 0.18
TTYH3-201ENST00000258796 SCRT1Q9BWW7 348 aa16.15■□□□□ 0.18
TTYH3-201ENST00000258796 PCNX1Q96RV3 2341 aa16.15■□□□□ 0.18
TTYH3-201ENST00000258796 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TTYH3-201ENST00000258796 IGKCP01834 107 aa16.15■□□□□ 0.18
TTYH3-201ENST00000258796 LY6EQ16553 131 aa16.15■□□□□ 0.18
TTYH3-201ENST00000258796 ERVK11-1P61568 191 aa16.15■□□□□ 0.18
TTYH3-201ENST00000258796 MLNRO43193 412 aa16.14■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 NCR2O95944 276 aa16.14■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.14■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 TRGV3P03979 118 aa16.14■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 FXYD7P58549 80 aa16.14■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 C19orf54Q5BKX5 351 aa16.14■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 CLEC19AQ6UXS0 136 aa16.14■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 COL4A6Q14031 1691 aa16.14■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 C18orf32Q8TCD1 76 aa16.14■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 GAGE12BA1L429 117 aa16.14■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF114Q8NC26 417 aa16.14■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 PLXNA2O75051 1894 aa16.13■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 HAPLN4Q86UW8 402 aa16.13■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 IGLC2P0DOY2 106 aa16.13■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 IGLC3P0DOY3 106 aa16.13■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 DDB2Q92466 427 aa16.13■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.13■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 TMEM105Q8N8V8 129 aa16.12■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa16.12■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa16.12■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 CEACAM4O75871 244 aa16.12■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 THADAQ6YHU6 1953 aa16.12■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 LYZL1Q6UWQ5 148 aa16.11■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 RPRMLQ8N4K4 120 aa16.11■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa16.11■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 JMJD8Q96S16 334 aa16.11■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 GTSCR1Q86UQ5 136 aa16.11■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 CD5LO43866 347 aa16.11■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 MEIG1Q5JSS6 88 aa16.11■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa16.11■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 TRGV9Q99603 122 aa16.1■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 FAM57AQ8TBR7 257 aa16.1■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 IGKV1-16P04430 117 aa16.1■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 TMPRSS3P57727 454 aa16.1■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.1■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 MED13LQ71F56 2210 aa16.1■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 GAGE13Q4V321 117 aa16.1■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 TIMM23O14925 209 aa16.09■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 SCGB1A1P11684 91 aa16.09■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 SLC50A1Q9BRV3 221 aa16.09■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF329Q86UD4 541 aa16.09■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 FNDC10F2Z333 226 aa16.09■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 LYNX1G3V0Z9 82 aa16.09■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 LYNX1P0DP58 116 aa16.09■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa16.08■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 NOTCH4Q99466 2003 aa16.08■□□□□ 0.17
TTYH3-201ENST00000258796 KIR3DS1Q14943 382 aa16.08■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 TMEM200BQ69YZ2 307 aa16.08■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 CLEC2AQ6UVW9 174 aa16.08■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 MRAP2Q96G30 205 aa16.08■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 F2Z2F3 143 aa16.08■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 IGLV3-1P01715 115 aa16.08■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa16.08■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa16.07■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 H0YJW9 148 aa16.07■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF815PA8K554 130 aa16.07■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 SMPXQ9UHP9 88 aa16.07■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 COL6A6A6NMZ7 2263 aa16.07■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 VCX2Q9H322 139 aa16.07■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 V9GYV3 84 aa16.07■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 A0A1B0GWJ7 208 aa16.06■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 TOMM40O96008 361 aa16.06■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 ORMDL2Q53FV1 153 aa16.06■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 TSPAN13O95857 204 aa16.06■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 SPOCK3Q9BQ16 436 aa16.05■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 ABCA4P78363 2273 aa16.05■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 PSMB11A5LHX3 300 aa16.05■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 SLAQ13239 276 aa16.05■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 COPS9Q8WXC6 57 aa16.05■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 TDGF1P13385 188 aa16.05■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 TNFRSF14Q92956 283 aa16.05■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 SLC25A2Q9BXI2 301 aa16.05■□□□□ 0.16
TTYH3-201ENST00000258796 UBE2L6O14933 153 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms