RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.78□□□□□ -0.04
CGRRF1-201ENST00000216420 SAP25Q8TEE9 199 aa14.78□□□□□ -0.04
CGRRF1-201ENST00000216420 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.78□□□□□ -0.04
CGRRF1-201ENST00000216420 VSTM5A8MXK1 200 aa14.77□□□□□ -0.04
CGRRF1-201ENST00000216420 E9PLD3 99 aa14.77□□□□□ -0.04
CGRRF1-201ENST00000216420 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
CGRRF1-201ENST00000216420 CCL4P13236 92 aa14.77□□□□□ -0.04
CGRRF1-201ENST00000216420 GP9P14770 177 aa14.77□□□□□ -0.04
CGRRF1-201ENST00000216420 Q5PR19 223 aa14.77□□□□□ -0.04
CGRRF1-201ENST00000216420 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.77□□□□□ -0.04
CGRRF1-201ENST00000216420 MTURNQ8N3F0 131 aa14.77□□□□□ -0.04
CGRRF1-201ENST00000216420 MRAP2Q96G30 205 aa14.77□□□□□ -0.04
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.77□□□□□ -0.04
CGRRF1-201ENST00000216420 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.77□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.77□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.77□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 NPIPB3Q92617 1050 aa14.77□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 Q9H3A6 140 aa14.77□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 TNCP24821 2201 aa14.76□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 A0A1W2PRD5 423 aa14.76□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 A0A1W2PRF3 423 aa14.76□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 A0A1W2PRM7 423 aa14.76□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 NKX2-8O15522 239 aa14.76□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 FXYD2P54710 66 aa14.76□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 LEAP2Q969E1 77 aa14.76□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 TM2D2Q9BX73 214 aa14.76□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 HBDP02042 147 aa14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM106CPP0CH98 169 aa14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 C18orf15Q96N68 181 aa14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 DSCAML1Q8TD84 2053 aa14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 CACNA1EQ15878 2313 aa14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 IGLV2-11P01706 119 aa14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 IGKV1-16P04430 117 aa14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 RITA1Q96K30 269 aa14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 OTORQ9NRC9 128 aa14.75□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 HLA-DRB4P13762 266 aa14.74□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 IFI27L1Q96BM0 104 aa14.74□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.74□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 PI4KAP42356 2102 aa14.74□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF785A8K8V0 405 aa14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 NMUP48645 174 aa14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 C3AR1Q16581 482 aa14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF502Q8TBZ5 544 aa14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 LAMA1P25391 3075 aa14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 PRR33A8MZF0 331 aa14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 PLAUP00749 431 aa14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 IGHV1-2P23083 117 aa14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 WFDC2Q14508 124 aa14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 TRGV9Q99603 122 aa14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 ZMAT4Q9H898 229 aa14.73□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 IGKV3-15P01624 115 aa14.72□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 THBDP07204 575 aa14.72□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 GCSHP23434 173 aa14.72□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 CRYBA4P53673 196 aa14.72□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.72□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 CRYGCP07315 174 aa14.72□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNRF1Q8ND25 227 aa14.72□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 CHAC1Q9BUX1 264 aa14.72□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 HES7Q9BYE0 225 aa14.72□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.71□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CGRRF1-201ENST00000216420 IGLL5B9A064 214 aa14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 NDUFS7O75251 213 aa14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 WT1-ASQ06250 92 aa14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 PRELID3AQ96N28 172 aa14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 CGB1A6NKQ9 187 aa14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 MC5RP33032 325 aa14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 CEND1Q8N111 149 aa14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.7□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.69□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.69□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 D6R8Y8 96 aa14.69□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 K7EQM0 130 aa14.69□□□□□ -0.06
CGRRF1-201ENST00000216420 ORM2P19652 201 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms