RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 NRN1Q9NPD7 142 aa13.75□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF492Q9P255 531 aa13.75□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 DPM3Q9P2X0 92 aa13.75□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 RNF114Q9Y508 228 aa13.75□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 DCHS1Q96JQ0 3298 aa13.75□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 A0A1B0GXF2 115 aa13.74□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 VWC2LB2RUY7 222 aa13.74□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 OR2J3O76001 311 aa13.74□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 AMTP48728 403 aa13.74□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 LYZP61626 148 aa13.74□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 TDRG1Q3Y452 100 aa13.74□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 C18orf32Q8TCD1 76 aa13.74□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 RASL11BQ9BPW5 248 aa13.74□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 OTORQ9NRC9 128 aa13.74□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 C19orf71A6NCJ1 209 aa13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 K7EIM0 57 aa13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 Q8N976 141 aa13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 VN1R17PQ8TDU5 208 aa13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM190Q8WZ59 177 aa13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 CFHR4Q92496 578 aa13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 SGK494Q96LW2 274 aa13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 CBLN4Q9NTU7 201 aa13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 MMDQ15546 238 aa13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 NPBQ8NG41 125 aa13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 NDUFA3O95167 84 aa13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 CNIH1O95406 144 aa13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 SSTP61278 116 aa13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 CDSNQ15517 529 aa13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 TIMD4Q96H15 378 aa13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 SNHG12Q9BXW3 62 aa13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 A8MWL6 223 aa13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 H3BTX0 84 aa13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 M0R1W7 72 aa13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 EREGO14944 169 aa13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 NBR2O15453 112 aa13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 ADORA2A-AS1P86434 159 aa13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 RPH3ALQ9UNE2 315 aa13.72□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 CEP295Q9C0D2 2601 aa13.71□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 CEACAM3P40198 252 aa13.71□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 UCNP55089 124 aa13.71□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 ARF6P62330 175 aa13.71□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 NIT1Q86X76 327 aa13.71□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 MIEN1Q9BRT3 115 aa13.71□□□□□ -0.21
CLDN11-201ENST00000064724 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa13.71□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 ODF3BA8MYP8 253 aa13.71□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 LY6HO94772 140 aa13.71□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 RAB4AP20338 218 aa13.71□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 KRTDAPP60985 99 aa13.71□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa13.71□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 VAMP8Q9BV40 100 aa13.71□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 GFRA4Q9GZZ7 299 aa13.71□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.7□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 P01737 135 aa13.7□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 PMCHP20382 165 aa13.7□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 PRTN3P24158 256 aa13.7□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 KLRB1Q12918 225 aa13.7□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 C11orf71Q6IPW1 123 aa13.7□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 RNF24Q9Y225 148 aa13.7□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 FAM231BA6NCW3 169 aa13.69□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 DIRC3C9JPN6 131 aa13.69□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 M0R143 59 aa13.69□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 IGLV2-11P01706 119 aa13.69□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 Q86TA4 180 aa13.69□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 GTSF1Q8WW33 167 aa13.69□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 HILPDAQ9Y5L2 63 aa13.69□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 LOC105371242A0A075B767 164 aa13.69□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 RNF224P0DH78 156 aa13.69□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 TCF24Q7RTU0 167 aa13.69□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 OR4B1Q8NGF8 309 aa13.69□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 PAM16Q9Y3D7 125 aa13.69□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 H3BRN7 92 aa13.68□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 CAMPP49913 170 aa13.68□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 HBBP68871 147 aa13.68□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF491Q8N8L2 437 aa13.68□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.68□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 A6NNC1 897 aa13.68□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.68□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.68□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 C3orf79P0CE67 100 aa13.67□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 IGLC2P0DOY2 106 aa13.67□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 C5orf64Q2M2E5 130 aa13.67□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 C16orf54Q6UWD8 224 aa13.67□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa13.67□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 LYPD1Q8N2G4 141 aa13.67□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 FAM19A2Q8N3H0 131 aa13.67□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 ABCA1O95477 2261 aa13.67□□□□□ -0.22
CLDN11-201ENST00000064724 ZZEF1O43149 2961 aa13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms