RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641582.1

CASC19-241, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,421 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-241ENST00000641582 PDZD9Q8IXQ8 264 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 NANPQ8TBE9 248 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 OR4C12Q96R67 309 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 Q9H8V8 135 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 NPVFQ9HCQ7 196 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 UQCC1Q9NVA1 299 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 MED9Q9NWA0 146 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 PITPNC1Q9UKF7 332 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 WDR83OSQ9Y284 106 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 HILPDAQ9Y5L2 63 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 DYSFO75923 2080 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 COL6A6A6NMZ7 2263 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 A0A1W2PRD5 423 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 A0A1W2PRF3 423 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 A0A1W2PRM7 423 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 LINC00862A6NCI5 91 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 SNURFLB1AK76 121 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 PRSS46E5RG02 174 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 TRIM77I1YAP6 450 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 CST7O76096 145 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 CA2P00918 260 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 HLA-DRB1P01911 266 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 MBP02144 154 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 IFNA4P05014 189 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 METTL15P1P0C7V9 234 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 XGP55808 180 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 DLX1P56177 255 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 SLC38A11Q08AI6 406 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 RAB31Q13636 194 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 HES1Q14469 280 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 FXYD3Q14802 87 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 PLGLAQ15195 96 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 TNXAQ16473 311 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 KLK9Q2XQG4 91 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 ALKAL2Q6UX46 152 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 COMMD1Q8N668 190 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 OR1P1Q8NH06 330 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 RASL10AQ92737 203 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 RASL11BQ9BPW5 248 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 SMIM3Q9BZL3 60 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 FBXL15Q9H469 300 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 WFDC1Q9HC57 220 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 SPTA1P02549 2419 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 BTBD17A6NE02 478 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 H3BP45 60 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 TEX46H3BTG2 121 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 CNIH1O95406 144 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 CRYGCP07315 174 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 NMBP08949 121 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 OR13C7P0DN81 318 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 S100A1P23297 94 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 ATP6V0CP27449 155 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 RAB2AP61019 212 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 SCGB2A2Q13296 93 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 CLINT1Q14677 625 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 ZNF709Q8N972 641 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 Q8N9W7 124 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 LFNGQ8NES3 379 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 ATP6V0BQ99437 205 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 C19orf24Q9BVV8 132 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 HINT2Q9BX68 163 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 PARP11Q9NR21 331 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 THYN1Q9P016 225 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 ZNF462Q96JM2 2506 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 CADP27708 2225 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 PRR14LQ5THK1 2151 aa3.11□□□□□ -1.91
CASC19-241ENST00000641582 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms