RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	LINC00473	A8K010	186 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	CD40	P25942	277 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	PSPN	O60542	156 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	FOXF2	Q12947	444 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ETDB	Q3ZM63	59 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	EML5	Q05BV3	1969 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	CFAP54	Q96N23	3096 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624		H7C2G1	150 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	PPBP	P02775	128 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	PRELID3A	Q96N28	172 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	PRSS47	A8MTI9	375 aa		10.02	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624		M0R1B8	84 aa		10.02	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	DTX1	Q86Y01	620 aa		10.02	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		10.02	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		10.02	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		10.02	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		10.02	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ZNF479	Q96JC4	524 aa		10.02	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		10.02	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	TAX1BP3	O14907	124 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	TOMM40	O96008	361 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624		Q6ZS49	121 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	MOB3B	Q86TA1	216 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	KLK15	Q9H2R5	256 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	MED13	Q9UHV7	2174 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	MGST3	O14880	152 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	MYOD1	P15172	320 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	NBL1	P41271	181 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	PSG7	Q13046	419 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	FADS6	Q8N9I5	356 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	RAB9A	P51151	201 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	SSPN	Q14714	243 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	ZNF146	Q15072	292 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	TTC32	Q5I0X7	151 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	CALY	Q9NYX4	217 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	TMEM189	A5PLL7	270 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	MLANA	Q16655	118 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	RPE	Q96AT9	228 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	FAM168A	Q92567	244 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	C9orf118	A6NHY6	69 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	APOM	O95445	188 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	PTGDS	P41222	190 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	MEOX1	P50221	254 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	SARAF	Q96BY9	339 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	IL4	P05112	153 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	CLEC3B	P05452	202 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	PCOLCE	Q15113	449 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	OR4A5	Q8NH83	315 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	GAGE13	Q4V321	117 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	C2orf83	Q53S99	150 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	FOXC2	Q99958	501 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	EPDR1	Q9UM22	224 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	RNF114	Q9Y508	228 aa		10	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	PLXNB1	O43157	2135 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	ATP6V0B	Q99437	205 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	JPT1	Q9UK76	154 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	TMEM131	Q92545	1883 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PXN-222	ENST00000637624	WDR31	Q8NA23	367 aa		9.99	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms