RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PFDN2Q9UHV9 154 aa19.36■□□□□ 0.69
CAPNS1-217ENST00000629983 UCP1P25874 307 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGT1Q9H0U3 335 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK11Q9UBX7 282 aa19.35■□□□□ 0.69
CAPNS1-217ENST00000629983 APOA1P02647 267 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PSG1P11464 419 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-217ENST00000629983 RORCP51449 518 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PSG9Q00887 426 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-217ENST00000629983 EBLN2Q6P2I7 272 aa19.34■□□□□ 0.69
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CAPNS1-217ENST00000629983 OR52E5Q8NH55 327 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFAND1Q8TCF1 268 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM208Q9BTX3 173 aa19.34■□□□□ 0.69
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
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CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf158Q8N1D5 194 aa19.33■□□□□ 0.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 ARRDC1Q8N5I2 433 aa19.32■□□□□ 0.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N1X5 172 aa19.3■□□□□ 0.68
CAPNS1-217ENST00000629983 SCRT2Q9NQ03 307 aa19.3■□□□□ 0.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 NUDT3O95989 172 aa19.29■□□□□ 0.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 ELK1P19419 428 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8G2PQ6IF36 304 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM170AQ8WVE7 144 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R14BQ96C90 147 aa19.29■□□□□ 0.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM222Q9H0R3 208 aa19.29■□□□□ 0.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 FAM25AB3EWG3 89 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM25CB3EWG5 89 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM25GB3EWG6 89 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-217ENST00000629983 HPGDSO60760 199 aa19.28■□□□□ 0.68
CAPNS1-217ENST00000629983 MARCH1Q8TCQ1 289 aa19.28■□□□□ 0.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 TERB2Q8NHR7 220 aa19.26■□□□□ 0.67
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CAPNS1-217ENST00000629983 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
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CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB130AP0DP74 79 aa19.25■□□□□ 0.67
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CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH3B2P48448 385 aa19.25■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM268Q5VZI3 342 aa19.25■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4D10Q8NGI6 311 aa19.25■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52I2Q8NH67 350 aa19.25■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 YIPF6Q96EC8 236 aa19.25■□□□□ 0.67
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CAPNS1-217ENST00000629983 F5H768 121 aa19.24■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ISLRO14498 428 aa19.24■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 NMSQ5H8A3 153 aa19.24■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA12Q7Z6I5 190 aa19.24■□□□□ 0.67
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CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf194Q5T5A4 169 aa19.23■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 GLYATL2Q8WU03 294 aa19.23■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf92Q96LL3 132 aa19.23■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa19.23■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 NAA60Q9H7X0 242 aa19.23■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAH5Q8TE73 4624 aa19.22■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 APOBP04114 4563 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 LYRM9A8MSI8 78 aa19.22■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB3DO95716 219 aa19.22■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF90Q03938 601 aa19.22■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 VCX3AQ9NNX9 186 aa19.22■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 FABP1P07148 127 aa19.21■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2F1Q13607 317 aa19.21■□□□□ 0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35E1Q96K37 410 aa19.21■□□□□ 0.67
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