RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 SSR3Q9UNL2 185 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-204ENST00000610404 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 CORTO00230 105 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 HLA-DMAP28067 261 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 ETV6P41212 452 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 TAS2R46P59540 309 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 DHODHQ02127 395 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 CNBD2Q96M20 576 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 NRN1Q9NPD7 142 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 BUB3O43684 328 aa6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 PTTG1IPP53801 180 aa6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 TAS2R20P59543 309 aa6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 DAD1P61803 113 aa6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 BSXQ3C1V8 233 aa6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 SPARTQ8N0X7 666 aa6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 ATG101Q9BSB4 218 aa6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 A0A0G2JRQ6 117 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 SCGB2A1O75556 95 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 NXPH3O95157 252 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 HBE1P02100 147 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 IL4P05112 153 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 S100GP29377 79 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 HSPA13P48723 471 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 RND2P52198 227 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 AKR1C2P52895 323 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 GABARAPL2P60520 117 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 TSPAN5P62079 268 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 ZNF79Q15937 498 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 Q8WTZ3 238 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 TP53RKQ96S44 253 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 DIRC3C9JPN6 131 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 F6UB75 175 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 SOCS3O14543 225 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 PRM2P04554 102 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 OR10J1P30954 320 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 TGFBR1P36897 503 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 UCP3P55916 312 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 LINC00052Q96N35 136 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 ENY2Q9NPA8 101 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.11□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 EPM2AB3EWF7 344 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 PRSS3P35030 304 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 RORCP51449 518 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 RND3P61587 244 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 RRN3P1Q2M238 152 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 SP6Q3SY56 376 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 GPX8Q8TED1 209 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 NPIPB3Q92617 1050 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 FCGR1BQ92637 280 aa6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 A0A0J9YX75 114 aa6.09□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 F5H768 121 aa6.09□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 M0QYG6 137 aa6.09□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 TOMM40O96008 361 aa6.09□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 RD3LP0DJH9 198 aa6.09□□□□□ -1.43
TTR-204ENST00000610404 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.09□□□□□ -1.43
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