RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 PKD1P98161 4303 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CDS2O95674 445 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 EMP1P54849 157 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB1P60022 68 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SPANXN2Q5MJ10 180 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 GDF5OSQ5U4N7 250 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC190Q86UF4 302 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 NPIPB3Q92617 1050 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 NEU1Q99519 415 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM222Q9H0R3 208 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNG5Q9UF02 275 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GALNT1O75752 331 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CD74P04233 296 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 GLYATL2Q8WU03 294 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 MIXL1Q9H2W2 232 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TOMM40O96008 361 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SPART-AS1P0CW21 52 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFSF8P32971 234 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 FXYD7P58549 80 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR146Q96CH1 333 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD1Q96SE0 405 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 EXTL2Q9UBQ6 330 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CEBPZOSA8MTT3 80 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNA10P01566 189 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV3-20P01619 116 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 RD3LP0DJH9 198 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM229BQ8NBD8 167 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ACY3Q96HD9 319 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB3DO95716 219 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 MEF2DQ14814 521 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 FAAP20Q6NZ36 180 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZR54 194 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51G1Q8NGK1 321 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 NAA60Q9H7X0 242 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM189A5PLL7 270 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 PSG1P11464 419 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R19P59542 299 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ETFRF1Q6IPR1 90 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 STEAP1BQ6NZ63 245 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 DIRAS2Q96HU8 199 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 RABL2BQ9UNT1 228 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM9A6NGZ8 99 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNA21P01568 189 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM268Q5VZI3 342 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 DKK2Q9UBU2 259 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM222AQ5U5X8 452 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF709Q8N972 641 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF125Q96EQ8 232 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RFNGQ9Y644 331 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 NMSQ5H8A3 153 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 GSG1LQ6UXU4 331 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF575Q86XF7 245 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM210BQ96KR6 192 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00052Q96N35 136 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 V9GYH0 126 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 FABP12A6NFH5 140 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PBDC1Q9BVG4 233 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 SOCS3O14543 225 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXI2Q6ZQN5 318 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 SOSTQ9BQB4 213 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC32Q9BV29 185 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35B3Q9H1N7 401 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 HTN3P15516 51 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 NOXA1Q86UR1 476 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4B1Q8NGF8 309 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 CLUHP3Q96NS8 147 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR13Q9NZ81 148 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMB3P49720 205 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-211ENST00000590874 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF79Q15937 498 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8G2PQ6IF36 304 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR132Q9UNW8 380 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-211ENST00000590874 GABARAPH6UMI1 98 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-211ENST00000590874 SULT1A3P0DMM9 295 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-211ENST00000590874 SULT1A4P0DMN0 295 aa18.19■□□□□ 0.5
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