RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590638.5

NEDD4L-230, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene NEDD4L, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-230	ENST00000590638	PAX6	P26367	422 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	SNCA	P37840	140 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	C2orf83	Q53S99	150 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	TEX29	Q8N6K0	151 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	NANP	Q8TBE9	248 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	GINS3	Q9BRX5	216 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	GGACT	Q9BVM4	153 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	TNC	P24821	2201 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638		A0A0U1RQK1	487 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	ZNF320	A2RRD8	509 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	ATP6V0E1	O15342	81 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	CNIH1	O95406	144 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	AANAT	Q16613	207 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	BSX	Q3C1V8	233 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	CLLU1	Q5K131	121 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	OCC1	Q8TAD7	63 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638		Q9H8V8	135 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638		E7EUB6	86 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	FNDC10	F2Z333	226 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	BMPR1B	O00238	502 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	FCN1	O00602	326 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	CA2	P00918	260 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	TSHB	P01222	138 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	OR13C7	P0DN81	318 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	ATP6V0C	P27449	155 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	SULT1A2	P50226	295 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	RAB5C	P51148	216 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	GNB1	P62873	340 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	WT1-AS	Q06250	92 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	FXYD3	Q14802	87 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	UHRF2	Q96PU4	802 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	SSX3	Q99909	188 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	FBN3	Q75N90	2809 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	DNHD1	Q96M86	4753 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638		A0A1B0GW64	132 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	UMAD1	C9J7I0	102 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	PRSS46	E5RG02	174 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	CORT	O00230	105 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	FGF16	O43320	207 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	HLA-DRB1	P01911	266 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	SERF2	P84101	59 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	ZNF709	Q8N972	641 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638		Q8N9W7	124 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	PIFO	Q8TCI5	191 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	P2RX4	Q99571	388 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	PLXNB1	O43157	2135 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	NF1	P21359	2839 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	HIVEP1	P15822	2718 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	SMCO3	A2RU48	225 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NEDD4L-230	ENST00000590638	LINC00862	A6NCI5	91 aa		6.04	□□□□□ -1.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms