RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51G1Q8NGK1 321 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 FN1P02751 2386 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-23P01764 117 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM122CQ6P4D5 195 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8WTZ3 238 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 HRH4Q9H3N8 390 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC3BP05452 202 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5G3P0C626 314 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR183P32249 361 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF726P1Q15940 193 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 GCSAMLQ5JQS6 135 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 SFT2D1Q8WV19 159 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 TGOLN2O43493 480 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFA7O95182 113 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF343Q6P1L6 599 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC19AQ6UXS0 136 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 IL34Q6ZMJ4 242 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 MYOZ3Q8TDC0 251 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB24Q969Q5 203 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 COX7A2P2O60397 106 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2C1O95371 312 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF600Q6ZNG1 722 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A22Q9H936 323 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM37Q8WXS4 190 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 HYPMO75409 117 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 ADMP35318 185 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 RELQ04864 619 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM78BQ5VT40 261 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf113Q5VZT2 155 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A7AQ86SG5 101 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHDC1Q8N7A1 406 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 FUT9Q9Y231 359 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRDL1Q9BU40 450 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 LCN15Q6UWW0 184 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 SSX7Q7RTT5 188 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF491Q8N8L2 437 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 MARC2Q969Z3 335 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF125Q96EQ8 232 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-206ENST00000588815 STAG3L2P0CL84 134 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 STAG3L3P0CL85 134 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R45P59539 299 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf99Q6UWK7 81 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4X2Q8NGF9 303 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1B1Q8NGR6 318 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2E2Q96LR5 201 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB19A4D1S5 217 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ORM2P19652 201 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 LYZP61626 148 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PATE2Q6UY27 113 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 COMMD7Q86VX2 200 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 IL4P05112 153 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A7P31151 101 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL3P36405 182 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01006Q8NI28 216 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 DOK5Q9P104 306 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 HIGD1AQ9Y241 93 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PMS2P11Q13670 270 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 LCNL1Q6ZST4 164 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5AU1Q8NGC0 362 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4F5Q8NH21 305 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 CXorf1O96002 111 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00305Q7Z4B0 112 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 WFDC12Q8WWY7 111 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 GNB4Q9HAV0 340 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF24Q9Y225 148 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-11P01762 117 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 C8orf88P0DMB2 117 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 KHDC3LQ587J8 217 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PQLC2Q6ZP29 291 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMB3P49720 205 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 PBDC1Q9BVG4 233 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-206ENST00000588815 BMPR1BO00238 502 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 PPT1P50897 306 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 MIR17HGQ75NE6 70 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 STXBP6Q8NFX7 210 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM210AQ96ND0 272 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GV50 99 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP5D1E7EU14 171 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 GGCTO75223 188 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
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