RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584377.5

CSNK1D-222, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 2,891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGLV2-23	P01705	113 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	DLX6	P56179	175 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	RBPJ	Q06330	500 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	MUC15	Q8N387	334 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	CGB1	A6NKQ9	187 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	C8orf88	P0DMB2	117 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	GNG4	P50150	75 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	CENPW	Q5EE01	88 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	PRR27	Q6MZM9	219 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	NIT1	Q86X76	327 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	SMIM12	Q96EX1	92 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	GGTLC3	B5MD39	225 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377		K7ERU9	68 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC25A17	O43808	307 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF137P	P52743	207 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	LGALS4	P56470	323 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	MC5R	P33032	325 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CSNK1D-222	ENST00000584377	SPTA1	P02549	2419 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377		K7ENP7	123 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGHV3-48	P01763	117 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	REG1A	P05451	166 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	MORN5	Q5VZ52	161 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	NPIPB3	Q92617	1050 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	RITA1	Q96K30	269 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377		A0A1W2PRE2	83 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	PSMB11	A5LHX3	300 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	CD3E	P07766	207 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	PMCHL1	Q16048	86 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	BORCS7	Q96B45	105 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377		B9A039	149 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	TAX1BP3	O14907	124 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM87A	P0C7U9	286 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377		A0A1W2PPI3	338 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR2T8	A6NH00	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	COX7A2P2	O60397	106 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	NTF3	P20783	257 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	RIPPLY3	P57055	190 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	RPEL1	Q2QD12	228 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	TIGIT	Q495A1	244 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	MMD2	Q8IY49	270 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377		V9GYV3	84 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	LGALS7	P47929	136 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	PPOX	P50336	477 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	PLXNB1	O43157	2135 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	GAGE12B	A1L429	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGLL1	P15814	213 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	MPV17L2	Q567V2	206 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	TOX4	O94842	621 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	PLAU	P00749	431 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	DLX1	P56177	255 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	TSKU	Q8WUA8	353 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	SPINK4	O60575	86 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CSNK1D-222	ENST00000584377	LYNX1	P0DP58	116 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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