RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 PAFAH1B2P68402 229 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 IQCJQ1A5X6 159 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 MSMPQ1L6U9 139 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TCF23Q7RTU1 214 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 DTX2Q86UW9 622 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 THAP8Q8NA92 274 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 OR1P1Q8NH06 330 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TIMD4Q96H15 378 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 NABP2Q9BQ15 211 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 OSTCQ9NRP0 149 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 IL36BQ9NZH7 164 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 XKRY2A2RUG3 117 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 HELTA6NFD8 242 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 DPRXA6NFQ7 191 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 OOSP1A8MZH6 123 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 C22orf46C9J442 243 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 PHOX2AO14813 284 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 SLC31A2O15432 143 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 COX7A2P2O60397 106 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 PKIAP61925 76 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 GNB1P62873 340 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 CCL8P80075 99 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 RPEL1Q2QD12 228 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 FAM78BQ5VT40 261 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 MIC13Q5XKP0 118 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TEX38Q6PEX7 206 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 OR4X1Q8NH49 305 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 FRZBQ92765 325 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 RFNGQ9Y644 331 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 K7EIL1 84 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 OR7C2O60412 319 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 IGHV2-70P01814 119 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 HLA-DQA1P01909 254 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 RAB4AP20338 218 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 GNG10P50151 68 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 GAMTQ14353 236 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 PSG5Q15238 335 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TRGV9Q99603 122 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 HINT2Q9BX68 163 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PPE3 182 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 M0R1W7 72 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 IGKV1-16P04430 117 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 LINC00869P0C866 280 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ESDP10768 282 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ATP5G3P48201 142 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 PLP1P60201 277 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ZNF90Q03938 601 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 SPINK9Q5DT21 86 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 CT83Q5H943 113 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.43□□□□□ -1.38
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