RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569504.5

TSNAXIP1-216, Transcript of translin associated factor X interacting protein 1, human

TSL 2

Gene TSNAXIP1, Length 2,009 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	RHOG	P84095	191 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	CXorf1	O96002	111 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504		Q56UQ5	140 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	RNF2	Q99496	336 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	IGKV1-17	P01599	117 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	CD81	P60033	236 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	RHEB	Q15382	184 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	KLK9	Q2XQG4	91 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	C15orf32	Q32M92	178 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	NECAP1	Q8NC96	275 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	PSMB11	A5LHX3	300 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	AP4M1	O00189	453 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	IGHV3-23	P01764	117 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	ORM2	P19652	201 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	PSMB3	P49720	205 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504		Q6ZS46	218 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	RD3L	P0DJH9	198 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	PSG1	P11464	419 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TAS2R45	P59539	299 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	HYPM	O75409	117 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	SCGB2A1	O75556	95 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	PATE2	Q6UY27	113 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	GCHFR	P30047	84 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	LYZ	P61626	148 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	UHRF2	Q96PU4	802 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TXN2	Q99757	166 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	OR2T8	A6NH00	312 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504		F8W735	103 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	PAGE4	O60829	102 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	HNF1A	P20823	631 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TVP23C	Q96ET8	276 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	COLCA2	A8K830	154 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	OR7C2	O60412	319 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TOMM40	O96008	361 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	C8orf88	P0DMB2	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	PLP1	P60201	277 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TRGV3	P03979	118 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	MORN5	Q5VZ52	161 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	FAM223B	A6NKX1	122 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	UBE2G2	P60604	165 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	ATP5G2	Q06055	141 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	OR4F5	Q8NH21	305 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	OR4F4	Q96R69	305 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504		H3BUA1	57 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TPPP2	P59282	170 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	ISOC2	Q96AB3	205 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	CTSG	P08311	255 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	GPR183	P32249	361 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSNAXIP1-216	ENST00000569504	CST9LP1	Q5W188	147 aa		13.41	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms