RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 NBEAP1P0C6P0 100 aa18.41■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa18.41■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 EPDR1Q9UM22 224 aa18.41■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 NBASA2RRP1 2371 aa18.4■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 SPINK4O60575 86 aa18.4■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 RPL19P84098 196 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 NPBQ8NG41 125 aa18.4■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 HIGD1AQ9Y241 93 aa18.4■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 LRBAP50851 2863 aa18.4■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 PSG1P11464 419 aa18.4■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 PKIAP61925 76 aa18.4■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 TMEM183BQ1AE95 376 aa18.4■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 FAM231DQ6ZW35 169 aa18.4■□□□□ 0.54
EHD4-202ENST00000569223 PGPA6NDG6 321 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 NDUFA3O95167 84 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 CRISP2P16562 243 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 LYZP61626 148 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 LEMD1Q68G75 181 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 WDR73Q6P4I2 378 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 DCHS2Q6V1P9 2916 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 A0A1W2PRD5 423 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 A0A1W2PRF3 423 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 A0A1W2PRM7 423 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 CD24P25063 80 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 SLC35B1P78383 322 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 FBLN7Q53RD9 439 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 ASPHD1Q5U4P2 390 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 TMEM136Q6ZRR5 245 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 RELNP78509 3460 aa18.38■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 A0A1W2PPR1 153 aa18.38■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 CA1P00915 261 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 MT-ND6P03923 174 aa18.38■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 FAM209BQ5JX69 171 aa18.38■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 CMTM2Q8TAZ6 248 aa18.38■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 FAM168AQ92567 244 aa18.38■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 PRO1933Q9H354 126 aa18.38■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 K7EIM0 57 aa18.37■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 LINC00310P59036 64 aa18.37■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 UBE2G1P62253 170 aa18.37■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 LY6DQ14210 128 aa18.37■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 COX19Q49B96 90 aa18.37■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 MBD6Q96DN6 1003 aa18.37■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 RASL11BQ9BPW5 248 aa18.37■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 NAT8BQ9UHF3 227 aa18.37■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 GATCO43716 136 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 C7orf69Q9H7B7 122 aa18.37■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 KLF12Q9Y4X4 402 aa18.37■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 IZUMO1RA6ND01 250 aa18.36■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 IGKV1-17P01599 117 aa18.36■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 AMY1AP04745 511 aa18.36■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 RPH3ALQ9UNE2 315 aa18.36■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 TSTD3H0UI37 97 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 H3BTX0 84 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 HES1Q14469 280 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 ZNF600Q6ZNG1 722 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 VMO1Q7Z5L0 202 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 C5orf17Q8NAS9 161 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 NUDT10Q8NFP7 164 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 NUDT11Q96G61 164 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 Q9H3A6 140 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 COL6A6A6NMZ7 2263 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 ESDP10768 282 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 CDKN1AP38936 164 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 Q0VG73 95 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 C5orf64Q2M2E5 130 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 GRAMD2BQ96HH9 432 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 ATG101Q9BSB4 218 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 SERF1AO75920 110 aa18.34■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 KIR3DL3Q8N743 410 aa18.34■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 SGK494Q96LW2 274 aa18.34■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 TMEM14CQ9P0S9 112 aa18.34■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 PRR27Q6MZM9 219 aa18.33■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 DYNAPQ8N1N2 210 aa18.33■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
EHD4-202ENST00000569223 F2Z2F3 143 aa18.33■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 RAB4BP61018 213 aa18.33■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 SMIM12Q96EX1 92 aa18.33■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 ZZEF1O43149 2961 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 NDUFS7O75251 213 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 BAGE3Q86Y29 109 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 MS4A10Q96PG2 267 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 SPTBN4Q9H254 2564 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 TOMM40O96008 361 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 HLA-DQA1P01909 254 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 TCRAP04437 139 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 PAX1P15863 534 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 DDTP30046 118 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 TPPP2P59282 170 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD4-202ENST00000569223 DEFA6Q01524 100 aa18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms