RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.95□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 K7ENP7 123 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZWC4 215 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 THAP8Q8NA92 274 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPEQ96AT9 228 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TBX15Q96SF7 602 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GNB4Q9HAV0 340 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPIAL4GP0DN37 164 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TEX45Q8NA69 505 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SIGLEC9Q9Y336 463 aa9.94□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PGPA6NDG6 321 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WDR73Q6P4I2 378 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGFBPL1Q8WX77 278 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PERPQ96FX8 193 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UBE2G1P62253 170 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPP1R27Q86WC6 154 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MED13LQ71F56 2210 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLV1-47P01700 117 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SRIP30626 198 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRR31Q5SQ13 230 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF253O75346 499 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HYPMO75409 117 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FSTL3O95633 263 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AMY1AP04745 511 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PAX1P15863 534 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CDKN1AP38936 164 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PAFAH1B2P68402 229 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF841Q6ZN19 808 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CBLN4Q9NTU7 201 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TOX4O94842 621 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MT-ND6P03923 174 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LYZP61626 148 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VN1R17PQ8TDU5 208 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NUDT11Q96G61 164 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SIAH2O43255 324 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CNIH1O95406 144 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NBEAP1P0C6P0 100 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PMCHP20382 165 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TDRG1Q3Y452 100 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RCHY1Q96PM5 261 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EPDR1Q9UM22 224 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1W2PRD5 423 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1W2PRF3 423 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1W2PRM7 423 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CORTO00230 105 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCL21O00585 134 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CD24P25063 80 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KRTDAPP60985 99 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q0VG73 95 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TNFRSF14Q92956 283 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRGV9Q99603 122 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HILPDAQ9Y5L2 63 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BMPR1BO00238 502 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 APCSP02743 223 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RBP4P02753 201 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CRYGCP07315 174 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BRS3P32247 399 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AMTP48728 403 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HLA-DQA1P01909 254 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CRYGBP07316 175 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CAMPP49913 170 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARF6P62330 175 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TEX22C9J3V5 150 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLAQ13239 276 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MMDQ15546 238 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NUP35Q8NFH5 326 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR8B3Q8NGG8 313 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms