RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF429Q86V71 674 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SLC24A4Q8NFF2 622 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 OR5B3Q8NH48 314 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 C15orf40Q8WUR7 153 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM190Q8WZ59 177 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 TSC22D3Q99576 134 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 NEURL2Q9BR09 285 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SEC22CQ9BRL7 303 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 TUBA4BQ9H853 241 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 MAP6D1Q9H9H5 199 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 GPR132Q9UNW8 380 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 I3L2K1 104 aa3.2□□□□□ -1.9
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TMOD3-204ENST00000558666 CRYGCP07315 174 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 P0C879 139 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 ANXA3P12429 323 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 CBLN1P23435 193 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 NPY1RP25929 384 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 AP3S2P59780 193 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 S100A10P60903 97 aa3.2□□□□□ -1.9
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TMOD3-204ENST00000558666 OR2F1Q13607 317 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SMCO1Q147U7 214 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 TATDN3Q17R31 274 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 LEMD1Q68G75 181 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
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TMOD3-204ENST00000558666 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 STXBP6Q8NFX7 210 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 DTD1Q8TEA8 209 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 CXorf58Q96LI9 332 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 RCHY1Q96PM5 261 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 RNF2Q99496 336 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 B9D2Q9BPU9 175 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SOSTQ9BQB4 213 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 NUDT15Q9NV35 164 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SLC2A8Q9NY64 477 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 THYN1Q9P016 225 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 RABAC1Q9UI14 185 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.2□□□□□ -1.9
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TMOD3-204ENST00000558666 A8MWP6 167 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 OR11H12B2RN74 326 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 UBE2CO00762 179 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 LYRM1O43325 122 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 GAGE7O76087 117 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 TPPPO94811 219 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 ATG12O94817 140 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFB6O95139 128 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SFT2D2O95562 160 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 CDS2O95674 445 aa3.19□□□□□ -1.9
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TMOD3-204ENST00000558666 CTSGP08311 255 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 OR4E1P0C645 316 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 GAGE12FP0CL80 117 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 GAGE12GP0CL81 117 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 GAGE12IP0CL82 117 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 INSL3P51460 131 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 DEFB1P60022 68 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SPCS3P61009 180 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 LYZP61626 148 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 DHODHQ02127 395 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 AKR1C1Q04828 323 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 TNFRSF9Q07011 255 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 GAGE1Q13065 139 aa3.19□□□□□ -1.9
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TMOD3-204ENST00000558666 DHRS2Q13268 280 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 DEFB135Q30KP9 77 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 DEFB114Q30KQ6 69 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 FAM106AQ4KMX7 169 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 NMSQ5H8A3 153 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SPANXN5Q5MJ07 72 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 FAM122CQ6P4D5 195 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 TCF24Q7RTU0 167 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.19□□□□□ -1.9
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