RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, human

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDSP2-208	ENST00000552294		A0A1W2PS18	150 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294		A8MTW9	85 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	HBE1	P02100	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	OR10J1	P30954	320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	PSG9	Q00887	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	EBAG9	O00559	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	SNCA	P37840	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	PAX9	P55771	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	TAS2R20	P59543	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	TNXB	P22105	4242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	TOMM40	O96008	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	PSMB9	P28065	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	OR2F1	Q13607	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294		Q8WTZ3	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294		A0A087WTM6	91 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	CBY3	A6NI87	242 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	HTN1	P15515	57 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	CCL18	P55774	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	OR5I1	Q13606	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	FRZB	Q92765	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	C8orf4	Q9NR00	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294		A0A096LPF7	62 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	ATP5G1	P05496	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	ATP5G3	P48201	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	PSMB3	P49720	205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	PIGP	P57054	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	ICAM4	Q14773	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTDSP2-208	ENST00000552294	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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