RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549123.5

TCTN1-222, Transcript of tectonic family member 1, human

TSL 2

Gene TCTN1, Length 458 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCTN1-222	ENST00000549123	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	NECAP1	Q8NC96	275 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR11H1	Q8NG94	326 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	COQ8A	Q8NI60	647 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ENKUR	Q8TC29	256 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	MITD1	Q8WV92	249 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	P2RX4	Q99571	388 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	GNB4	Q9HAV0	340 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	NUDT15	Q9NV35	164 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	COA4	Q9NYJ1	87 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	THYN1	Q9P016	225 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CACNG5	Q9UF02	275 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CCL24	O00175	119 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	PRAF2	O60831	178 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	PITX3	O75364	302 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR2J3	O76001	311 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TSHB	P01222	138 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	IFNA21	P01568	189 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	IFNA17	P01571	189 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	IGHV3-11	P01762	117 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	PRH1	P02810	166 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	REG1A	P05451	166 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CLEC3B	P05452	202 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR8U8	P0C7N1	319 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ATP5G2	Q06055	141 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF616	Q08AN1	781 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SMCO1	Q147U7	214 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	C15orf32	Q32M92	178 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	PLET1	Q6UQ28	207 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR1P1	Q8NH06	330 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	HINT2	Q9BX68	163 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	PALMD	Q9NP74	551 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ENY2	Q9NPA8	101 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	LINC01619	G3V211	115 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	MED6	O75586	246 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ADAP1	O75689	374 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	PTTG1	O95997	202 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SNCA	P37840	140 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	MFAP2	P55001	183 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	RHOG	P84095	191 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TNFRSF9	Q07011	255 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	DEFB136	Q30KP8	78 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	BSX	Q3C1V8	233 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	C2orf83	Q53S99	150 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SPINK9	Q5DT21	86 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR1S1	Q8NH92	325 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	DTD1	Q8TEA8	209 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CXorf58	Q96LI9	332 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR5B12	Q96R08	314 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ATP6V0B	Q99437	205 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	RBKS	Q9H477	322 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123		U3KQ87	197 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	VWF	P04275	2813 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		3.28	□□□□□ -1.89
TCTN1-222	ENST00000549123		A0A087WW49	117 aa		3.27	□□□□□ -1.89
TCTN1-222	ENST00000549123	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		3.27	□□□□□ -1.89

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms