RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 DIP2BQ9P265 1576 aa2.6□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 TRBV19A0A075B6N1 114 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A087WWV3 80 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 C1QL1O75973 258 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 ARMS2P0C7Q2 107 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 CDCP2Q5VXM1 449 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 C9orf139Q6ZV77 190 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZVQ6 151 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 C1orf210Q8IVY1 113 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 FBXL7Q9UJT9 491 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 PIK3C2BO00750 1634 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 CXCL13O43927 109 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 IGF1P05019 195 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV3-43DP0DP04 118 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 MAVSQ7Z434 540 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 NEURL3Q96EH8 262 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 KNDC1Q76NI1 1749 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 LTBP3Q9NS15 1303 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 BPY2O14599 106 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF876PQ49A33 203 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 DEFB119Q8N690 84 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 C5orf56Q8N8D9 126 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 CLEC2BQ92478 149 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 CFHR4Q92496 578 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 CCL19Q99731 98 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A1B0GW64 132 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 FOXL2P58012 376 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 FXYD3Q14802 87 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 LIMD2Q9BT23 127 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A1W2PRU2 124 aa2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM189BP81408 668 aa2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 DEFB115Q30KQ5 88 aa2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 SPINK9Q5DT21 86 aa2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 LYZL1Q6UWQ5 148 aa2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A0A0MQY5 61 aa2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 F5H768 121 aa2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CCL22O00626 93 aa2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 UBE2D3P61077 147 aa2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 B9D1Q9UPM9 204 aa2.59□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 NXPH4O95158 308 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 GASTP01350 101 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CRYGBP07316 175 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CTRLP40313 264 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM53BQ14153 422 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 KISS1Q15726 138 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 FHL5Q5TD97 284 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC00479Q96M42 142 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 GFRA4Q9GZZ7 299 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 MICAL3Q7RTP6 2002 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 J3QRE1 110 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 NBEAP1P0C6P0 100 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 NOVP48745 357 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 KIAA0087Q14695 138 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZQY7 126 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZVL8 140 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 SCXQ7RTU7 201 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 C12orf77C9JDV5 145 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 C8orf87E5RJ46 101 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 NPYP01303 97 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 CCL8P80075 99 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 LILRA6Q6PI73 481 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 PPLO60437 1756 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 SNAI2O43623 268 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 GLI4P10075 376 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 GATA4P43694 442 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 DEFB110Q30KQ9 67 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM201AQ5SY85 155 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 H0YGG7 62 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 NCR3O14931 201 aa2.58□□□□□ -2
JMJD1C-210ENST00000542921 MST1P26927 711 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 170.6 ms