RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 CBLN4Q9NTU7 201 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 KAAG1Q9UBP8 84 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ZANQ9Y493 2812 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ZFHX3Q15911 3703 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ARID1AO14497 2285 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 SFT2D2O95562 160 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 GYPAP02724 150 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 C1QBP02746 253 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 RLN2P04090 185 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 COL8A2P25067 703 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 KIR2DS2P43631 304 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 DLX6P56179 175 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 IL15RAQ13261 267 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 Q5BKY6 102 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 PNKDQ8N490 385 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 FAM216BQ8N7L0 139 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 OR1L1Q8NH94 360 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 GALNT14Q96FL9 552 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 MRAP2Q96G30 205 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 ARV1Q9H2C2 271 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 PTPN13Q12923 2485 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 LYNX1G3V0Z9 82 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 BET1O15155 118 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 SSNA1O43805 119 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 HBZP02008 142 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 AKR1C4P17516 323 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 SSTR5P35346 364 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 LYPD2Q6UXB3 125 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 DYNLRB1Q9NP97 96 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 ABCA2Q9BZC7 2435 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 A6NDN8 102 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 SLC22A5O76082 557 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 SIX6O95475 246 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 CD34P28906 385 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.13□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 LHFPL5Q8TAF8 219 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 UBALD1Q8TB05 177 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 GALMQ96C23 342 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 TP53RKQ96S44 253 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 P2RX4Q99571 388 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 NAA60Q9H7X0 242 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 MED13LQ71F56 2210 aa3.13□□□□□ -1.91
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