RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524035.5

MEG3-222, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 2,853 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-222	ENST00000524035	IGLV2-8	P01709	118 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	GNG5	P63218	68 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	NIT2	Q9NQR4	276 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	S100A2	P29034	98 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	LMO4	P61968	165 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	NDP	Q00604	133 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	IL36B	Q9NZH7	164 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035		V9GYV3	84 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	FABP4	P15090	132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	CX3CL1	P78423	397 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	TBX15	Q96SF7	602 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	XKRY2	A2RUG3	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	IGKV1-17	P01599	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	SGK494	Q96LW2	274 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	PEX7	O00628	323 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM11	P17152	192 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	ACACB	O00763	2458 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	OVOL3	O00110	214 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	GP9	P14770	177 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035		Q8N6K4	173 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	ARPC1A	Q92747	370 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	PGP	A6NDG6	321 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	GCG	P01275	180 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	PLP1	P60201	277 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	RPEL1	Q2QD12	228 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	PYY3	Q5JQD4	70 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	ISLR	O14498	428 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	RD3L	P0DJH9	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	MYCNOS	P40205	109 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	AJUBA	Q96IF1	538 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	SPINK4	O60575	86 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		13.52	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		13.52	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.52	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	OOSP1	A8MZH6	123 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	CBLN1	P23435	193 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	TCL1A	P56279	114 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	SAA4	P35542	130 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	UBE2E1	P51965	193 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	EBI3	Q14213	229 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	EPDR1	Q9UM22	224 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	IGHV3-23	P01764	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	TAS2R60	P59551	318 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	SLC35B1	P78383	322 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	BAGE2	Q86Y30	109 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	BTF3L4	Q96K17	158 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	OSTC	Q9NRP0	149 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	RNF224	P0DH78	156 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	ADM	P35318	185 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035		A0A1B0GUS0	222 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	FAM168A	Q92567	244 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035		Q9H3A6	140 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-222	ENST00000524035	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms