RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 IL36BQ9NZH7 164 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CLN8Q9UBY8 286 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 NAGKQ9UJ70 344 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 JPT1Q9UK76 154 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ARID1AO14497 2285 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CEP192Q8TEP8 1941 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 BRWD1Q9NSI6 2320 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MED12Q93074 2177 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 UNC13CQ8NB66 2214 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 A0A0U1RQK1 487 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZNF320A2RRD8 509 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 HPRT1P00492 218 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 KRASP01116 189 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR9G9P0C7N8 305 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 LINC00614P0C842 121 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 KITLGP21583 273 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 GCHFRP30047 84 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MAGEA5P43359 124 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TPPP2P59282 170 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 POU2AF1Q16633 256 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 PRSS8Q16651 343 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 UBALD2Q8IYN6 164 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TMEM256Q8N2U0 113 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR4B1Q8NGF8 309 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 HES7Q9BYE0 225 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR2J1Q9GZK6 312 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CXXC4Q9H2H0 198 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 PRO3102Q9H379 93 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CBLN4Q9NTU7 201 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CLCF1Q9UBD9 225 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MYO7BQ6PIF6 2116 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 KNL1Q8NG31 2342 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 C5orf42Q9H799 3197 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CDH23Q9H251 3354 aa3.14□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 NCKAP5O14513 1909 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GUS0 222 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 FAM166BA8MTA8 275 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 K7EN84 100 aa3.13□□□□□ -1.91
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SGCE-211ENST00000522045 REG1AP05451 166 aa3.13□□□□□ -1.91
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SGCE-211ENST00000522045 DEFA4P12838 97 aa3.13□□□□□ -1.91
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SGCE-211ENST00000522045 CFHR2P36980 270 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MPV17P39210 176 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CTRLP40313 264 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RPL29P47914 159 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SRYQ05066 204 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MZT1Q08AG7 82 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 PSG7Q13046 419 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RTL8BQ17RB0 113 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 WDR82Q6UXN9 313 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZR03 302 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 PNKDQ8N490 385 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 Q8N976 141 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR4S2Q8NH73 311 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SGMS2Q8NHU3 365 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 UBALD1Q8TB05 177 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SDSLQ96GA7 329 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SLC35E1Q96K37 410 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 KCNS1Q96KK3 526 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TBX15Q96SF7 602 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 DERL1Q9BUN8 251 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
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