RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 TOR2AQ5JU69 321 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 PATE2Q6UY27 113 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 OR1B1Q8NGR6 318 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 C17orf112F2Z3M2 114 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 MPDU1O75352 247 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 TSPAN15O95858 294 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 NPBWR1P48145 328 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 LYZP61626 148 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 SLC35B1P78383 322 aa11.97□□□□□ -0.49
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TRPS1-206ENST00000517323 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 KLK9Q9UKQ9 250 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 FAM223BA6NKX1 122 aa11.96□□□□□ -0.49
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TRPS1-206ENST00000517323 LCN15Q6UWW0 184 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-206ENST00000517323 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.96□□□□□ -0.49
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TRPS1-206ENST00000517323 TRGV9Q99603 122 aa11.96□□□□□ -0.49
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TRPS1-206ENST00000517323 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa11.96□□□□□ -0.5
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TRPS1-206ENST00000517323 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.96□□□□□ -0.5
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF491Q8N8L2 437 aa11.96□□□□□ -0.5
TRPS1-206ENST00000517323 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.96□□□□□ -0.5
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TRPS1-206ENST00000517323 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
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TRPS1-206ENST00000517323 TOMM40O96008 361 aa11.92□□□□□ -0.5
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TRPS1-206ENST00000517323 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-206ENST00000517323 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-206ENST00000517323 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-206ENST00000517323 RNF125Q96EQ8 232 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF320A2RRD8 509 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-206ENST00000517323 UMAD1C9J7I0 102 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-206ENST00000517323 H3BTX0 84 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-206ENST00000517323 BRI3O95415 125 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-206ENST00000517323 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-206ENST00000517323 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
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