RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-222ENST00000512014 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 BUB3O43684 328 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 SCGB2A1O75556 95 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 IFNA4P05014 189 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 RD3LP0DJH9 198 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
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SH3BP2-222ENST00000512014 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.31□□□□□ -0.92
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SH3BP2-222ENST00000512014 S100ZQ8WXG8 99 aa9.31□□□□□ -0.92
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SH3BP2-222ENST00000512014 ID3Q02535 119 aa9.3□□□□□ -0.92
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SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF688P0C7X2 276 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 RNF125Q96EQ8 232 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 SLC35E1Q96K37 410 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 HELTA6NFD8 242 aa9.28□□□□□ -0.92
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SH3BP2-222ENST00000512014 KNCNA6PVL3 124 aa9.28□□□□□ -0.92
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SH3BP2-222ENST00000512014 MED6O75586 246 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 INPP1P49441 399 aa9.28□□□□□ -0.92
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SH3BP2-222ENST00000512014 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 RAB11AP62491 216 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF846Q147U1 533 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 TRGV9Q99603 122 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP2-222ENST00000512014 H3BP45 60 aa9.27□□□□□ -0.93
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SH3BP2-222ENST00000512014 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
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SH3BP2-222ENST00000512014 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
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SH3BP2-222ENST00000512014 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
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SH3BP2-222ENST00000512014 MITD1Q8WV92 249 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 C17orf77Q96MU5 243 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.27□□□□□ -0.93
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SH3BP2-222ENST00000512014 OR2F1Q13607 317 aa9.26□□□□□ -0.93
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SH3BP2-222ENST00000512014 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 NRN1Q9NPD7 142 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 CENPXA8MT69 81 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 SOCS3O14543 225 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 LYZP61626 148 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 PMS2P11Q13670 270 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 C4orf46Q504U0 113 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 PSMG4Q5JS54 123 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 OR11H2Q8NH07 326 aa9.25□□□□□ -0.93
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SH3BP2-222ENST00000512014 RARRES2Q99969 163 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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SH3BP2-222ENST00000512014 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 SNRPGP15A8MWD9 76 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 SSSCA1O60232 199 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 TCRBP04435 133 aa9.24□□□□□ -0.93
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SH3BP2-222ENST00000512014 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 SMIM8Q96KF7 97 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 CCDC32Q9BV29 185 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 PSENENQ9NZ42 101 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 IFNA21P01568 189 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-222ENST00000512014 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.23□□□□□ -0.93
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