RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 HIST1H2BBP33778 126 aa3.02□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 HIST1H2BDP58876 126 aa3.02□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.02□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 HIST1H2BCP62807 126 aa3.02□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.02□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 CCDC153Q494R4 210 aa3.02□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.02□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.02□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.02□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 CDC42P60953 191 aa3.01□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 IFT20Q8IY31 132 aa3.01□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 BET1O15155 118 aa3□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 LY6HO94772 140 aa3□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 SRIP30626 198 aa3□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 EMP1P54849 157 aa3□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 TAS2R20P59543 309 aa3□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 CCDC58Q4VC31 144 aa3□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 TMEM69Q5SWH9 247 aa3□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 AADACL3Q5VUY0 350 aa3□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 LCA10Q71F78 164 aa3□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 LYG1Q8N1E2 194 aa3□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 THADAQ6YHU6 1953 aa3□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 ZNF292O60281 2723 aa2.99□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 CHD7Q9P2D1 2997 aa2.99□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa2.99□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 C19orf71A6NCJ1 209 aa2.99□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 GADD45GO95257 159 aa2.99□□□□□ -1.93
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