RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 CLEC3BP05452 202 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 STAG3L2P0CL84 134 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 STAG3L3P0CL85 134 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 NPBWR1P48145 328 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 SELENOTP62341 195 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 ATP5G2Q06055 141 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.27□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 LCN15Q6UWW0 184 aa7.27□□□□□ -1.25
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SEC22C-216ENST00000493107 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.27□□□□□ -1.25
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SEC22C-216ENST00000493107 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.26□□□□□ -1.25
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SEC22C-216ENST00000493107 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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SEC22C-216ENST00000493107 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.26□□□□□ -1.25
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SEC22C-216ENST00000493107 A6NJY4 79 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 PPP5D1E7EU14 171 aa7.25□□□□□ -1.25
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SEC22C-216ENST00000493107 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 LINC01006Q8NI28 216 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 SUN5Q8TC36 379 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 FAM210AQ96ND0 272 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 RARRES2Q99969 163 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 FUT9Q9Y231 359 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.25□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 RAB19A4D1S5 217 aa7.24□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 BMPR1BO00238 502 aa7.24□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 HYPMO75409 117 aa7.24□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 IGHV3-11P01762 117 aa7.24□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 ORM2P19652 201 aa7.24□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 RHOBP62745 196 aa7.24□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.24□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 TEX38Q6PEX7 206 aa7.24□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 RNF125Q96EQ8 232 aa7.24□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 C17orf77Q96MU5 243 aa7.24□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 UHRF2Q96PU4 802 aa7.24□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.23□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 H3BRN7 92 aa7.23□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 NDUFA7O95182 113 aa7.23□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 HBE1P02100 147 aa7.23□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 IL4P05112 153 aa7.23□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 C8orf88P0DMB2 117 aa7.23□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 LYZP61626 148 aa7.23□□□□□ -1.25
SEC22C-216ENST00000493107 GUK1Q16774 197 aa7.23□□□□□ -1.25
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