RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1B0GW15 77 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 GGT3PA6NGU5 568 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAAHO00519 579 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBL3O95164 117 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFNA14P01570 189 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC35E2BP0CK96 405 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 DDTP30046 118 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSR2P43308 183 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNJ3P48549 501 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB13P51153 203 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 QRFPP83859 136 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SBSNQ6UWP8 590 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 OOSP2Q86WS3 158 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TBC1D19Q8N5T2 526 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM251Q8N6I4 163 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPERTQ8NA61 448 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 WFDC11Q8NEX6 87 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RASSF5Q8WWW0 418 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPCDCQ96CD2 204 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 MROQ9BYG7 248 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC22A4Q9H015 551 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 TLNRD1Q9H1K6 362 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 DCSTAMPQ9H295 470 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 FUT9Q9Y231 359 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 COQ4Q9Y3A0 265 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 DOCK3Q8IZD9 2030 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 CASZ1Q86V15 1759 aa-0.78□□□□□ -2.53
CACNA2D1-211ENST00000486539 NESP48681 1621 aa-0.78□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP3K5Q99683 1374 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP3K19Q56UN5 1328 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 FABP5P3A8MUU1 101 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUPR1O60356 82 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF682O95780 498 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 GP1BAP07359 652 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCL4P13236 92 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CXCL2P19875 107 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 S100A7P31151 101 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 BLIDQ8IZY5 108 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR10AC1Q8NH08 325 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR10J5Q8NHC4 309 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 METTL9Q9H1A3 318 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 EURLQ9NYK6 297 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL36BQ9NZH7 164 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 RABL2BQ9UNT1 228 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 WIZO95785 1651 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 NWD1Q149M9 1564 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PEG3Q9GZU2 1588 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CUX1P39880 1505 aa-0.79□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 RTL1A6NKG5 1358 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 I3L521 148 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 AZIN1O14977 448 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCL16O15467 120 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 NEMFO60524 1076 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SRP19P09132 144 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SFTPCP11686 197 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPI1P17947 270 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CXCL3P19876 107 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTNP21246 168 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP2K4P45985 399 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPINT3P49223 89 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 KISS1Q15726 138 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 C4orf26Q17RF5 130 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TEX261Q6UWH6 196 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 C5orf46Q6UWT4 87 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB132Q7Z7B7 95 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2T27Q8NH04 317 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 JOSD2Q8TAC2 188 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ROPN1LQ96C74 230 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SERPINB11Q96P15 392 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASCL3Q9NQ33 180 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM14CQ9P0S9 112 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ENPP5Q9UJA9 477 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANAPC10Q9UM13 185 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 U3KQ87 197 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 WDR97A6NE52 1622 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms