RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DDX39B-215ENST00000462256 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.38□□□□□ -1.23
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DDX39B-215ENST00000462256 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.37□□□□□ -1.23
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DDX39B-215ENST00000462256 ARV1Q9H2C2 271 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 RAB32Q13637 225 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 GALNT14Q96FL9 552 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-215ENST00000462256 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.36□□□□□ -1.23
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