RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 F5P12259 2224 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 ZNF785A8K8V0 405 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 COX7A2P2O60397 106 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 IGHV3-7P01780 117 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 GRPP07492 148 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 GP9P14770 177 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 S100A7P31151 101 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 TAL2Q16559 108 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 PDPNQ86YL7 162 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 PERPQ96FX8 193 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 CALYQ9NYX4 217 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 CHEK1O14757 476 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 NCR2O95944 276 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 IGKV3-15P01624 115 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 MPV17P39210 176 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 CCL11P51671 97 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 RIGQ13278 110 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 Q86TA4 180 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 VGLL1Q99990 258 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 GNG12Q9UBI6 72 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 DKK4Q9UBT3 224 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 E9PLD3 99 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 IGLV2-11P01706 119 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 TCRAP04437 139 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 PMS2CLQ68D20 193 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 TRGV9Q99603 122 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 J3QR89 54 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 SMIM13P0DJ93 91 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 PYYP10082 97 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 A0A1B0GUT8 65 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 ZNHIT1O43257 154 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 CER1O95813 267 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 LHBP01229 141 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 APOA2P02652 100 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 SRYQ05066 204 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 TMEM177Q53S58 311 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 OTORQ9NRC9 128 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 MOB3BQ86TA1 216 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 RFESDQ8TAC1 157 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 TM4SF5O14894 197 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 R4GN57 208 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 A0A1B0GWB2 263 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 IGLV1-44P01699 117 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 ACP1P24666 158 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 SPINK2P20155 84 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 EVI2AP22794 236 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 GNG5P63218 68 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 SCGB2A2Q13296 93 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 RND1Q92730 232 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 MRAP2Q96G30 205 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 A0A1W2PRD5 423 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 A0A1W2PRF3 423 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 A0A1W2PRM7 423 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 CGB1A6NKQ9 187 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 HBDP02042 147 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 PRO0461Q9UI25 63 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 PGPA6NDG6 321 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-208ENST00000441439 PRSS47A8MTI9 375 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms