RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD36A6QL64 1941 aa12.02□□□□□ -0.49
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PTPRU-204ENST00000428026 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 ACTL10Q5JWF8 245 aa12.01□□□□□ -0.49
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PTPRU-204ENST00000428026 B9A039 149 aa12□□□□□ -0.49
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PTPRU-204ENST00000428026 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 WFDC12Q8WWY7 111 aa12□□□□□ -0.49
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PTPRU-204ENST00000428026 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
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PTPRU-204ENST00000428026 RNF144BQ7Z419 303 aa11.99□□□□□ -0.49
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PTPRU-204ENST00000428026 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa11.98□□□□□ -0.49
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PTPRU-204ENST00000428026 D6R8Y8 96 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 ASCL2Q99929 193 aa11.98□□□□□ -0.49
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PTPRU-204ENST00000428026 ZNF138P52744 262 aa11.98□□□□□ -0.49
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PTPRU-204ENST00000428026 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.97□□□□□ -0.49
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PTPRU-204ENST00000428026 A0A1B0GW64 132 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 TRAV21A0A0B4J279 112 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 NRN1LQ496H8 165 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRU-204ENST00000428026 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
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PTPRU-204ENST00000428026 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRU-204ENST00000428026 A0A1B0GUS0 222 aa11.96□□□□□ -0.5
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PTPRU-204ENST00000428026 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.96□□□□□ -0.5
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PTPRU-204ENST00000428026 POLEQ07864 2286 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRU-204ENST00000428026 C5orf63A6NC05 138 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRU-204ENST00000428026 PINLYPA6NC86 204 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRU-204ENST00000428026 NBR2O15453 112 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRU-204ENST00000428026 PPBPP02775 128 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRU-204ENST00000428026 HTN3P15516 51 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRU-204ENST00000428026 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRU-204ENST00000428026 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRU-204ENST00000428026 IGKV1-5P01602 117 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRU-204ENST00000428026 CD28P10747 220 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRU-204ENST00000428026 ESDP10768 282 aa11.95□□□□□ -0.5
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