RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XCL2Q9UBD3 114 aa9.45□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0G2JRQ6 117 aa9.44□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.44□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYRM1O43325 122 aa9.44□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPY1RP25929 384 aa9.44□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8WTZ3 238 aa9.44□□□□□ -0.9
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPG2P98160 4391 aa9.44□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUC4Q99102 2169 aa9.44□□□□□ -0.9
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.43□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRN1Q9NPD7 142 aa9.43□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COPZ2Q9P299 210 aa9.43□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa9.42□□□□□ -0.9
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A4P12235 298 aa9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-DRB4P13762 266 aa9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10J1P30954 320 aa9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPCS3P61009 180 aa9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHODHQ02127 395 aa9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SP6Q3SY56 376 aa9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AARDQ4LEZ3 155 aa9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZRM9 215 aa9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52E5Q8NH55 327 aa9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM4Q8WVI0 70 aa9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEU1Q99519 415 aa9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.42□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABARAPH6UMI1 98 aa9.41□□□□□ -0.9
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD74P04233 296 aa9.41□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD3DP04234 171 aa9.41□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.41□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf83Q53S99 150 aa9.41□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.41□□□□□ -0.9
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.41□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.41□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLK11Q9UBX7 282 aa9.41□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.4□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM189A5PLL7 270 aa9.4□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BUB3O43684 328 aa9.4□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B3GALNT1O75752 331 aa9.4□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.4□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR13C8Q8NGS7 320 aa9.4□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.4□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.4□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.4□□□□□ -0.9
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.4□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOMM40O96008 361 aa9.4□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNA21P01568 189 aa9.4□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBPP20226 339 aa9.4□□□□□ -0.91
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMP1P54849 157 aa9.4□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP3S2P59780 193 aa9.4□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNP2Q05952 138 aa9.4□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZR54 194 aa9.4□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52I2Q8NH67 350 aa9.4□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.4□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM210BQ96KR6 192 aa9.4□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.39□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.39□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDS2O95674 445 aa9.39□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5AC1P0C628 307 aa9.39□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa9.39□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.39□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.39□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKAP14Q86UN6 197 aa9.39□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF575Q86XF7 245 aa9.39□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4D10Q8NGI6 311 aa9.39□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TERB2Q8NHR7 220 aa9.39□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LHFPL5Q8TAF8 219 aa9.39□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.39□□□□□ -0.91
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTFP1Q9UDX5 166 aa9.39□□□□□ -0.91
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