RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 FAM223BA6NKX1 122 aa15.62■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 CLDN34H7C241 214 aa15.62■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 IGHG4P01861 327 aa15.62■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 RD3LP0DJH9 198 aa15.62■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 PSMB8P28062 276 aa15.62■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 FAM223AQ8IWN6 122 aa15.62■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 OR1B1Q8NGR6 318 aa15.62■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 TMEM231Q9H6L2 316 aa15.62■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 A0A1W2PPV4 95 aa15.61■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 PPP5D1E7EU14 171 aa15.61■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 TSPAN9O75954 239 aa15.61■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 TRBV12-3P01733 135 aa15.61■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa15.61■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa15.6■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 H3BUA1 57 aa15.6■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 OR5G3P0C626 314 aa15.6■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 LYZP61626 148 aa15.6■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa15.6■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 TRAV5A0A0B4J249 113 aa15.6■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 COX7A2P2O60397 106 aa15.6■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 BRI3O95415 125 aa15.6■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 PBDC1Q9BVG4 233 aa15.6■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 SCRT1Q9BWW7 348 aa15.6■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa15.6■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 TOMM40O96008 361 aa15.59■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 RHOBP62745 196 aa15.59■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.59■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 OR51G1Q8NGK1 321 aa15.59■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 OR5B12Q96R08 314 aa15.59■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 TXN2Q99757 166 aa15.59■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa15.58■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa15.58■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 ARL14EPLP0DKL9 152 aa15.58■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 C10orf113Q5VZT2 155 aa15.58■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 IL34Q6ZMJ4 242 aa15.58■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 IQCF2Q8IXL9 164 aa15.58■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 ZNF491Q8N8L2 437 aa15.58■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 RARRES2Q99969 163 aa15.58■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 GNB4Q9HAV0 340 aa15.58■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 FUT9Q9Y231 359 aa15.58■□□□□ 0.09
ODC1-202ENST00000405333 IL4P05112 153 aa15.58■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 GATAD1Q8WUU5 269 aa15.58■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD34BA5PLL1 514 aa15.57■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 STAG3L2P0CL84 134 aa15.57■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 STAG3L3P0CL85 134 aa15.57■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 HAGHQ16775 308 aa15.57■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 TOR2AQ5JU69 321 aa15.57■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 LEMD1Q68G75 181 aa15.57■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 LINC00305Q7Z4B0 112 aa15.57■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 GNG13Q9P2W3 67 aa15.57■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 MAST4O15021 2626 aa15.57■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 C9JQL5 133 aa15.56■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 TGOLN2O43493 480 aa15.56■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 HBE1P02100 147 aa15.56■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 TEX38Q6PEX7 206 aa15.56■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 ZNF503Q96F45 646 aa15.56■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 USMG5Q96IX5 58 aa15.56■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 FAM210AQ96ND0 272 aa15.56■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 HYPMO75409 117 aa15.56■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 PLP1P60201 277 aa15.56■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 RNF125Q96EQ8 232 aa15.56■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 CRLF1O75462 422 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 CRYBA1P05813 215 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 SLC35B1P78383 322 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 GUK1Q16774 197 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 KLHDC1Q8N7A1 406 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 OR4X2Q8NGF9 303 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 OR1L4Q8NGR5 311 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 PFDN5Q99471 154 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 SLC25A2Q9BXI2 301 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 RAB19A4D1S5 217 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 Q8WTZ3 238 aa15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 JMJD1CQ15652 2540 aa15.54■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 OR2C1O95371 312 aa15.54■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 FABP1P07148 127 aa15.54■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 FOXE3Q13461 319 aa15.54■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 ZNF343Q6P1L6 599 aa15.54■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 C19orf24Q9BVV8 132 aa15.54■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 OR10J4P0C629 311 aa15.53■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 ARL3P36405 182 aa15.53■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa15.53■□□□□ 0.08
ODC1-202ENST00000405333 TOMM20LQ6UXN7 152 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms