RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 ERG28Q9UKR5 140 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 C9JQL5 133 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 OVOL1O14753 267 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFA3O95167 84 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 CELA3AP09093 270 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 FAM168AQ92567 244 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 OSTCQ9NRP0 149 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087WX48 190 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 M0R2P5 195 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 CD7P09564 240 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 PYYP10082 97 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 HSD52Q0P140 79 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 VOPP1Q96AW1 172 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 Q9H3A6 140 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 MED13LQ71F56 2210 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PRE2 83 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1D-33P01593 117 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1-33P01594 117 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 UMODP07911 640 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 CD28P10747 220 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 CT83Q5H943 113 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 VWC2LB2RUY7 222 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 EREGO14944 169 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 CLPSP04118 112 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 WBP1Q96G27 269 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 COQ2Q96H96 371 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1D-12P01611 117 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 TFF1P04155 84 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 TIMP3P35625 211 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 PSG7Q13046 419 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 RNF144BQ7Z419 303 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 BMPERQ8N8U9 685 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 CACNA1BQ00975 2339 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 GZMBP10144 247 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF479Q96JC4 524 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 KLHDC3Q9BQ90 382 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 UPK2O00526 184 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 NBR2O15453 112 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-23P01764 117 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF883P0CG24 379 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00158P58513 81 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01551Q86U37 167 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 EFNA2O43921 213 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV4-39P01824 125 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 RHOGP84095 191 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 EFNB3Q15768 340 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 FHL1Q13642 323 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 RASL10AQ92737 203 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 ERVK11-1P61568 191 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 GAGE13Q4V321 117 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 MESP1Q9BRJ9 268 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 GFRA3O60609 400 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 LRRK1Q38SD2 2015 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0G2JMM0 328 aa7.36□□□□□ -1.23
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