RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 C9orf84Q5VXU9 1444 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUP155O75694 1391 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 MUC4Q99102 2169 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1orf196B1AJZ1 125 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIRO00625 290 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 ISG15P05161 165 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPCS3P61009 180 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 TEN1Q86WV5 123 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT222Q8N1A0 295 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM86BQ8N661 226 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLAMF6Q96DU3 332 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 USE1Q9NZ43 259 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYSLTR1Q9Y271 337 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-38P-201ENST00000384085 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
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RNU6-38P-201ENST00000384085 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 CASP1P29466 404 aa-0.35□□□□□ -2.47
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RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM151BQ6UXP7 276 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 GDPD1Q8N9F7 314 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC30A7Q8NEW0 376 aa-0.35□□□□□ -2.47
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RNU6-38P-201ENST00000384085 CECR2Q9BXF3 1484 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 HECW2Q9P2P5 1572 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBP1P09455 135 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q8IYB0 196 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 C20orf27Q9GZN8 174 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 WFDC10AQ9H1F0 79 aa-0.36□□□□□ -2.47
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RNU6-38P-201ENST00000384085 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa-0.37□□□□□ -2.47
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RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4C46A6NHA9 309 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 TIMM17BO60830 172 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 CALB1P05937 261 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 DYNLT1P63172 113 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST3H3Q16695 136 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPATA45Q537H7 98 aa-0.37□□□□□ -2.47
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RNU6-38P-201ENST00000384085 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
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RNU6-38P-201ENST00000384085 BDP1A6H8Y1 2624 aa-0.38□□□□□ -2.47
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RNU6-38P-201ENST00000384085 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa-0.4□□□□□ -2.47
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RNU6-38P-201ENST00000384085 ERC2-IT1O76042 136 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD3DP04234 171 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2F1Q13607 317 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
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RNU6-38P-201ENST00000384085 PTH2Q96A98 100 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF11Q9Y3C5 154 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGEF11O15085 1522 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF727A8MUV8 499 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMIM17P0DL12 118 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-38P-201ENST00000384085 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
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