RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEC14L6B5MCN3 397 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD5P06127 495 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP5G2Q06055 141 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCRT1Q9BWW7 348 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP21.53■■□□□ 1.042e-7■■■□□ 16.1
TRAPPC10-202ENST00000380221 MFAP4P55083 255 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1W2PPV4 95 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM89A2RUT3 159 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 F8W735 103 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM218A2RU14 115 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXE3Q13461 319 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 PEA15Q15121 130 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5AU1Q8NGC0 362 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF502Q8TBZ5 544 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLN5O75503 358 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELANEP08246 267 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 Q56UQ5 140 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 USMG5Q96IX5 58 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBFOX3A6NFN3 312 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF90Q03938 601 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4F5Q8NH21 305 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 C9JQL5 133 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGHV3-11P01762 117 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPBWR1P48145 328 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 HAGHQ16775 308 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC140Q96MF4 163 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRGV9Q99603 122 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 RARRES2Q99969 163 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2T8A6NH00 312 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 GNG7O60262 68 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 GNG13Q9P2W3 67 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 HAX1O00165 279 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGLC1P0CG04 106 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 SELENOTP62341 195 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLEC19AQ6UXS0 136 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF152Q8N8N0 203 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF114Q9Y508 228 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0G2JLM5 398 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR183P32249 361 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 RHOBP62745 196 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 TXN2Q99757 166 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLEC3BP05452 202 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 TIGITQ495A1 244 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF491Q8N8L2 437 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYOZ3Q8TDC0 251 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLPSL1A2RUU4 121 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGKV1-17P01599 117 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 SFTA3P0C7M3 94 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF506Q5JVG8 444 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5B12Q96R08 314 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 CTSGP08311 255 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADCYAP1P18509 176 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM78BQ5VT40 261 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 IQCF2Q8IXL9 164 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4X2Q8NGF9 303 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHRDL1Q9BU40 450 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 C19orf24Q9BVV8 132 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 STAG3L2P0CL84 134 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 STAG3L3P0CL85 134 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPT1P50897 306 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 ICAM4Q14773 271 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMDT1Q9H4I9 107 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 C2CD3Q4AC94 2353 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 F8W036 122 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFNA1P01562 189 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCL2P10415 239 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 PROK1P58294 105 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 PMS2P11Q13670 270 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF343Q6P1L6 599 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM37Q8WXS4 190 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 FUT9Q9Y231 359 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPP5D1E7EU14 171 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRBV12-3P01733 135 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5G3P0C626 314 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADMP35318 185 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 C11orf44Q8N8P7 122 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 RXFP4Q8TDU9 374 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 GNB4Q9HAV0 340 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 APOC3P02656 99 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 KHDC3LQ587J8 217 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 MIR17HGQ75NE6 70 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 GATAD1Q8WUU5 269 aa21.41■■□□□ 1.02
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