RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310252.11

TTLL3-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 1,561 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-201ENST00000310252 MISP3Q96FF7 219 aa9.01□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.01□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 MANBALQ9NQG1 85 aa9.01□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.01□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.01□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 TMEM89A2RUT3 159 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 ZFP92A6NM28 416 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 OR2J3O76001 311 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 IGHG4P01861 327 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 TRGV3P03979 118 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 NPY1RP25929 384 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 TPPP2P59282 170 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 RAB11AP62491 216 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 CFHR3Q02985 330 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 LCNL1Q6ZST4 164 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 OR4X2Q8NGF9 303 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 OR10G9Q8NGN4 311 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 OR10G7Q8NGN6 311 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 OR1L6Q8NGR2 347 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 THYN1Q9P016 225 aa9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 C5orf52A6NGY3 159 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 TMEM250H0YL14 139 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 IGLV1-40P01703 118 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 RAB9AP51151 201 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 PROK1P58294 105 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 RHOGP84095 191 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 ZNF709Q8N972 641 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 KLK15Q9H2R5 256 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 FNDC10F2Z333 226 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 H3BUA1 57 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 ELANEP08246 267 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 PSMB8P28062 276 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 OPRK1P41145 380 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 RND2P52198 227 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 MFAP2P55001 183 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 CD81P60033 236 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 FOXE3Q13461 319 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 C2orf83Q53S99 150 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 ZNF114Q8NC26 417 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.99□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 CORTO00230 105 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 UBE2CO00762 179 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 NDUFB8O95169 186 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 CD28P10747 220 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 ATP5G2Q06055 141 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 ELOBQ15370 118 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 BSXQ3C1V8 233 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 NECAP1Q8NC96 275 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 RAB24Q969Q5 203 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 SLC25A22Q9H936 323 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 S4R3C0 116 aa8.98□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 JMJD1CQ15652 2540 aa8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 A0A0G2JLM5 398 aa8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 SMCO3A2RU48 225 aa8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 MT-CO2P00403 227 aa8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 IGHV3-48P01763 117 aa8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 IGHV3-23P01764 117 aa8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 PSMB3P49720 205 aa8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 CEBPGP53567 150 aa8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 C15orf32Q32M92 178 aa8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 TREML4Q6UXN2 200 aa8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 ZFP82Q8N141 532 aa8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 NAT8Q9UHE5 227 aa8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 PLXNB1O43157 2135 aa8.97□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.96□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 FAM223BA6NKX1 122 aa8.96□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 IGHV3-11P01762 117 aa8.96□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 MLANAQ16655 118 aa8.96□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.96□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.96□□□□□ -0.97
TTLL3-201ENST00000310252 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms