RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.44□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 IL11RAQ14626 422 aa9.44□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.44□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 GCSAMQ8N6F7 178 aa9.44□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 WNT2P09544 360 aa9.44□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC25A38Q96DW6 304 aa9.44□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 HIVEP2P31629 2446 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 OR13A1Q8NGR1 328 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 SHISA9B4DS77 424 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 TFF3Q07654 80 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 WFDC6Q9BQY6 131 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PRE2 83 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 VSIG8P0DPA2 414 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 UCP1P25874 307 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 KLRD1Q13241 179 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 HRKO00198 91 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 CXCL10P02778 98 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 SRFP11831 508 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 SEC61GP60059 68 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 HLA-DQB1P01920 261 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 CEACAM1P13688 526 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 ZP4Q12836 540 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 CBLN3Q6UW01 205 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 PRB1P04280 392 aa9.43□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 F2Z2F3 143 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 HAX1O00165 279 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 ERCC8Q13216 396 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 PROB1E7EW31 1015 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 K7EP13 123 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 K7EP34 96 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 ZG16O60844 167 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 MMP23AO75900 390 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 R4GN57 208 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 TRGV3P03979 118 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 MAGEA5P43359 124 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 FSTP19883 344 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 LAIR2Q6ISS4 152 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 Q6ZS52 159 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 WBP1LQ9NX94 342 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PPC1 479 aa9.42□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 MP68P56378 58 aa9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM30BQ3MIR4 351 aa9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 KLK10O43240 276 aa9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 ARPC1AQ92747 370 aa9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM187Q14656 261 aa9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 MORN5Q5VZ52 161 aa9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 VN1R4Q7Z5H5 301 aa9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 SHISA5Q8N114 240 aa9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 GZMMP51124 257 aa9.41□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 SHISA7A6NL88 538 aa9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 UPK3AO75631 287 aa9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 ABHD12Q8N2K0 398 aa9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 RASL10AQ92737 203 aa9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 LIPT2A6NK58 231 aa9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC25A28Q96A46 364 aa9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 NPIPB13A6NJU9 1138 aa9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 MPV17L2Q567V2 206 aa9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 CDKN1BP46527 198 aa9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 COX14Q96I36 57 aa9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 FNDC10F2Z333 226 aa9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 UPK2O00526 184 aa9.4□□□□□ -0.9
HDGFL3-201ENST00000299633 ZIC3O60481 467 aa9.4□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.4□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 LRRK2Q5S007 2527 aa9.4□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.4□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.39□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.39□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.39□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.39□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A0U1RQV1 116 aa9.39□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 TSKUQ8WUA8 353 aa9.39□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 CALYQ9NYX4 217 aa9.39□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.39□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.39□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 PF4P02776 101 aa9.39□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF708P17019 499 aa9.39□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 ZAR1Q86SH2 424 aa9.39□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.39□□□□□ -0.91
HDGFL3-201ENST00000299633 TCF19Q9Y242 345 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 179.6 ms