RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CLECL1Q8IZS7 167 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CLDN22Q8N7P3 220 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 C8orf76Q96K31 380 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 LINC00467Q9BRT7 94 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 RNF122Q9H9V4 155 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TVP23BQ9NYZ1 205 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 FBXO5Q9UKT4 447 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 NEO1Q92859 1461 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 UBR2Q8IWV8 1755 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 NCOA1Q15788 1441 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 MYLKQ15746 1914 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TRAV3A0A0B4J244 114 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 hADV38S2A0JD32 116 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CCL16O15467 120 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 DHFRP00374 187 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 SRP14P37108 136 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 HIST1H3AP68431 136 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 H3F3AP84243 136 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 PLPP5Q8NEB5 264 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 ARL5BQ96KC2 179 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 YPEL2Q96QA6 119 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TP53RKQ96S44 253 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 GPER1Q99527 375 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 BCL2L10Q9HD36 194 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 ORMDL1Q9P0S3 153 aa0.31□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TNS3Q68CZ2 1445 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 KMT2DO14686 5537 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 OR2T8A6NH00 312 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 C1orf196B1AJZ1 125 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CCL25O15444 150 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 PDE6DO43924 150 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CNIH1O95406 144 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 SERPINE1P05121 402 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 MYL5Q02045 173 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 SPA17Q15506 151 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 DEFB113Q30KQ7 82 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 Q6Q795 121 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 SLC30A7Q8NEW0 376 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 OR2T35Q8NGX2 323 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CANT1Q8WVQ1 401 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 NIT2Q9NQR4 276 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 C14orf105Q9NVL8 296 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TNFSF18Q9UNG2 199 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TCHHQ07283 1943 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CITO14578 2027 aa0.3□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 HECW1Q76N89 1606 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 NUPR1O60356 82 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 GADD45GO95257 159 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF682O95780 498 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 IGLV3-1P01715 115 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 SMIM17P0DL12 118 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 FAM236CP0DP71 79 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 EFNA4P52798 201 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 C12orf74Q32Q52 190 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM97Q5BJF2 176 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 LINC00575Q6W349 94 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 SLC25A40Q8TBP6 338 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 SLAMF6Q96DU3 332 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 BTF3L4Q96K17 158 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 PRADC1Q9BSG0 188 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 GLTPQ9NZD2 209 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 LY96Q9Y6Y9 160 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 ROBO3Q96MS0 1386 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa0.29□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 FANCMQ8IYD8 2048 aa0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 HECW2Q9P2P5 1572 aa0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 ITPR1Q14643 2758 aa0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 A0A087WUJ7 227 aa0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TLCD2A6NGC4 264 aa0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 A8MWV9 139 aa0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TIMM17BO60830 172 aa0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 NIPSNAP2O75323 286 aa0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 DYNLT1P63172 113 aa0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 BCL2L15Q5TBC7 163 aa0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 C4orf22Q6V702 233 aa0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TEN1Q86WV5 123 aa0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 OTUD6BQ8N6M0 293 aa0.28□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms