RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 PRCDQ00LT1 54 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 MEF2DQ14814 521 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 HOGA1Q86XE5 327 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 FRZBQ92765 325 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.33□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.32□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 DBX1A6NMT0 343 aa7.32□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 BTCP35070 178 aa7.32□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 TTC32Q5I0X7 151 aa7.32□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 TMEM17Q86X19 198 aa7.32□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 TMEM230Q96A57 120 aa7.32□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 C18orf15Q96N68 181 aa7.32□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 KLK11Q9UBX7 282 aa7.32□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 CLN5O75503 358 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 HBE1P02100 147 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 TCRBP04435 133 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 RLN1P04808 185 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 PTHLHP12272 177 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 NAT1P18440 290 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 HLA-DMAP28067 261 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 HERV-K104P61576 105 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 Q5VSD8 79 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 OR4A16Q8NH70 328 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 PRRT1Q99946 306 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 IFT46Q9NQC8 304 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 U3KQE9 123 aa7.31□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 MYCBP2O75592 4640 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 C7orf66A4D0T2 115 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 DISC1C4P0D8 188 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 NDUFB6O95139 128 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 SNCAP37840 140 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 TAS2R46P59540 309 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 RRN3P1Q2M238 152 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 AKAP14Q86UN6 197 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 GLMPQ8WWB7 406 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 NRN1Q9NPD7 142 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 NUDT15Q9NV35 164 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.29□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.29□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 RAB3DO95716 219 aa7.29□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 NUDT3O95989 172 aa7.29□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.29□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.29□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.29□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 OR4X1Q8NH49 305 aa7.29□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 Q9H8V8 135 aa7.29□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 MCUBQ9NWR8 336 aa7.29□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.29□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 A0A1W2PPQ1 181 aa7.28□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 LYRM9A8MSI8 78 aa7.28□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 CD3DP04234 171 aa7.28□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 IL5P05113 134 aa7.28□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 XGP55808 180 aa7.28□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 FXYD7P58549 80 aa7.28□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.28□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.28□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.28□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 SEC22AQ96IW7 307 aa7.28□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 SCGB3A2Q96PL1 93 aa7.28□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
USP41-201ENST00000292729 FAT1Q14517 4588 aa7.27□□□□□ -1.25
USP41-201ENST00000292729 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.27□□□□□ -1.25
USP41-201ENST00000292729 J3QL48 77 aa7.27□□□□□ -1.25
USP41-201ENST00000292729 GPR31O00270 319 aa7.27□□□□□ -1.25
USP41-201ENST00000292729 IGKV3-20P01619 116 aa7.27□□□□□ -1.25
USP41-201ENST00000292729 S100GP29377 79 aa7.27□□□□□ -1.25
USP41-201ENST00000292729 OPRK1P41145 380 aa7.27□□□□□ -1.25
USP41-201ENST00000292729 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
USP41-201ENST00000292729 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
USP41-201ENST00000292729 CLINT1Q14677 625 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms