RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641260.1

SAMMSON-210, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,308 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-210ENST00000641260 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.06□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 CEND1Q8N111 149 aa5.06□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.06□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.06□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 ELSPBP1Q96BH3 223 aa5.06□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.06□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.06□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 PRR13Q9NZ81 148 aa5.06□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa5.06□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 A8MWL6 223 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 PRRG2O14669 202 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 OVOL1O14753 267 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 CST7O76096 145 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 RBP4P02753 201 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 IL4P05112 153 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 ACYP1P07311 99 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 MGST1P10620 155 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 INSL3P51460 131 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 CLDN17P56750 224 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 NXPH1P58417 271 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 PFN3P60673 137 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 C4orf26Q17RF5 130 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 CR1LQ2VPA4 569 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 WDR38Q5JTN6 314 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 LYPD6Q86Y78 171 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 PIANPQ8IYJ0 282 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF525Q8N782 197 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TET1Q8NFU7 2136 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 FGF14Q92915 247 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 SCAMP4Q969E2 229 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 C11orf52Q96A22 123 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 DPH3Q96FX2 82 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 LINC00477Q96M19 166 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 LINC01600Q96MT4 127 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 PRSS27Q9BQR3 290 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 WFDC6Q9BQY6 131 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TAS2R4Q9NYW5 299 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 V9GYV3 84 aa5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 NCOR1O75376 2440 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 C5orf67F2Z3F1 127 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 LMX1BO60663 402 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 PPYP01298 95 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 GYPBP06028 91 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 LINC00271P0C7V0 271 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 CXCL8P10145 99 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 COX7CP15954 63 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 PSMB8P28062 276 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 HLA-DMBP28068 263 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 C1orf61Q13536 156 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 C12orf74Q32Q52 190 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 AMN1Q8IY45 258 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 C9orf85Q96MD7 179 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 MGST2Q99735 147 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TTTY10Q9BZA0 68 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TMEM222Q9H0R3 208 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TCF19Q9Y242 345 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 MYO16Q9Y6X6 1858 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa5.04□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa5.03□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.03□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.03□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.03□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 IGLV3-25P01717 112 aa5.03□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 PLA2G5P39877 138 aa5.03□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 CLDN2P57739 230 aa5.03□□□□□ -1.6
SAMMSON-210ENST00000641260 CD164Q04900 197 aa5.03□□□□□ -1.6
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