RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611117.1

TTC28-AS1_2.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_2, Length 157 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CHD9Q3L8U1 2897 aa-1.46□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 JMJD1CQ15652 2540 aa-1.46□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KIF27Q86VH2 1401 aa-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 A0A0J9YY10 115 aa-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 A0A1B0GX78 115 aa-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CCRL2O00421 344 aa-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TIMM17BO60830 172 aa-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ADAP1O75689 374 aa-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CCL1P22362 96 aa-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 COX6A2Q02221 97 aa-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR2T35Q8NGX2 323 aa-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CANT1Q8WVQ1 401 aa-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SERPINB11Q96P15 392 aa-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DOCK4Q8N1I0 1966 aa-1.47□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SCN8AQ9UQD0 1980 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRORSD1PA6NEY8 169 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 H0YIV9 168 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CYB5BO43169 146 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC35E2BP0CK96 405 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CAV3P56539 151 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MAP3K7CLP57077 242 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CXCR4P61073 352 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 STX3Q13277 289 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OCIAD2Q56VL3 154 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ERGIC3Q9Y282 383 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 WNK1Q9H4A3 2382 aa-1.48□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MED13LQ71F56 2210 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRAV10A0A0B4J240 114 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C7orf71A4D174 169 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ATP6V1G2O95670 118 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FADS2O95864 444 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TNNC1P63316 161 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CASC2Q6XLA1 102 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC51BQ86UW2 128 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR52L1Q8NGH7 329 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR8D4Q8NGM9 314 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CNBD2Q96M20 576 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IMUPQ9GZP8 106 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OSTCQ9NRP0 149 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OPTCQ9UBM4 332 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DKKL1Q9UK85 242 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR52A1Q9UKL2 312 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TTC41PQ6P2S7 1318 aa-1.49□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CADP27708 2225 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OTCP00480 354 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BATFQ16520 125 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GUK1Q16774 197 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C4orf22Q6V702 233 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IDO2Q6ZQW0 420 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GPATCH11Q8N954 259 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GDPD1Q8N9F7 314 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR13C4Q8NGS5 318 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LRRC20Q8TCA0 184 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DERL2Q9GZP9 239 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MS4A6AQ9H2W1 248 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR51I2Q9H344 312 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 COL6A3P12111 3177 aa-1.5□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IL3P08700 152 aa-1.51□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ETV6P41212 452 aa-1.51□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MAP2K4P45985 399 aa-1.51□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ROMO1P60602 79 aa-1.51□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HBA1P69905 142 aa-1.51□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 Q6ZS49 121 aa-1.51□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa-1.51□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP-1.51□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PCTPQ9UKL6 214 aa-1.51□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-1.51□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ERC2-IT1O76042 136 aa-1.52□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IFNA10P01566 189 aa-1.52□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SYCP1Q15431 976 aa-1.52□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BCL2L10Q9HD36 194 aa-1.52□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-1.52□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa-1.52□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GADD45GO95257 159 aa-1.53□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TYMSP04818 313 aa-1.53□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR4E1P0C645 316 aa-1.53□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CXCL8P10145 99 aa-1.53□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 F5P12259 2224 aa-1.53□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NF1P21359 2839 aa-1.53□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 COQ5Q5HYK3 327 aa-1.53□□□□□ -2.65
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR2T10Q8NGZ9 312 aa-1.53□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms