RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.25□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.25□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 DPRXA6NFQ7 191 aa6.25□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 IFITM1P13164 125 aa6.25□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 PCBD1P61457 104 aa6.25□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 CD69Q07108 199 aa6.25□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 Q96M66 194 aa6.25□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.25□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 RTTNQ86VV8 2226 aa6.25□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 FAM236CP0DP71 79 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 CRYBB3P26998 211 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 FHL3Q13643 280 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 WFDC2Q14508 124 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 PMCHL1Q16048 86 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 TMEM230Q96A57 120 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 H0YIZ8 118 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 CRLF1O75462 422 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 ATP5LO75964 103 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 PATE4P0C8F1 98 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 MYOD1P15172 320 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 MTCP1P56278 107 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 TAS2R46P59540 309 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 ARFRP1Q13795 201 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 A0A1W2PRD5 423 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 TMEM250H0YL14 139 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 GPX1P07203 203 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 ZNF708P17019 499 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 AMY2BP19961 511 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 C20orf173Q96LM9 149 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 ISLRO14498 428 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 APOA2P02652 100 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 RND3P61587 244 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 FOXI1Q12951 378 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 OR1C1Q15619 314 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 TIMD4Q96H15 378 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 Q96MF0 132 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 HES7Q9BYE0 225 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 NMES1Q9C002 83 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 GTF3C1Q12789 2109 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 HLA-DRB1P01911 266 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 ETDBQ3ZM63 59 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 KIR2DL4Q99706 377 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 ATP5SQ99766 215 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 A0A087X0K7 114 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 SERF1AO75920 110 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 MAGEA5P43359 124 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 TTC32Q5I0X7 151 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 C3orf56Q8N813 242 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 RPRMQ9NS64 109 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 ANGPTL7O43827 346 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 IGKV1D-12P01611 117 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 ECI1P42126 302 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 Q6Q795 121 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 GATD1Q8NB37 220 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 BORCS8Q96FH0 119 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 VGLL1Q99990 258 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 PEMTQ9UBM1 199 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 ZNF737O75373 536 aa6.21□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 C3orf79P0CE67 100 aa6.21□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 CNTFRP26992 372 aa6.21□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 GALR1P47211 349 aa6.21□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 ICAM4Q14773 271 aa6.21□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
HCG18-244ENST00000602516 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.21□□□□□ -1.41
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