RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593072.5

EFTUD2-225, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 5

Gene EFTUD2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-225	ENST00000593072	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
EFTUD2-225	ENST00000593072	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.66	□□□□□ -1.66
EFTUD2-225	ENST00000593072	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072		A8MWP6	167 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072		E7EUB6	86 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	HRAS	P01112	189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	MYOD1	P15172	320 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	AREG	P15514	252 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	NQO2	P16083	231 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	HLA-G	P17693	338 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	GPR183	P32249	361 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	AKR1C2	P52895	323 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	H2BFS	P57053	126 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072		Q6ZRM9	215 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.65	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	UPK2	O00526	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TSPAN4	O14817	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RTL8C	O15255	209 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	ATG12	O94817	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IFNA21	P01568	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	C4BPB	P20851	252 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	PSMB6	P28072	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	HTR2B	P41595	481 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR2B8P	P59922	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	ERVK-16	P61578	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	CTAG1A	P78358	180 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.64	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072		A0A1B0GU03	582 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072		A0A1B0GW64	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	LCE2B	O14633	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	PITX3	O75364	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	KBTBD11	O94819	623 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	NXPH3	O95157	252 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TCTA	P57738	103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IL15RA	Q13261	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	CXorf58	Q96LI9	332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR2A7	Q96R45	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms