RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 HELZP42694 1942 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 B9A039 149 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 IL18BPO95998 194 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 Q8NFD4 153 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 NUP35Q8NFH5 326 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 COQ2Q96H96 371 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 PSG8Q9UQ74 426 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 CACNA1EQ15878 2313 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 SYT8Q8NBV8 401 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FBXL15Q9H469 300 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 SMPXQ9UHP9 88 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 CD33P20138 364 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FOXC2Q99958 501 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 DPM3Q9P2X0 92 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1B0GWB2 263 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 WISP1O95388 367 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 LMO1P25800 156 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 TNFRSF14Q92956 283 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 C17orf100A8MU93 164 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 CD5LO43866 347 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FOXH1O75593 365 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 DLX6P56179 175 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 KIR2DL4Q99706 377 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV1-39P01597 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV1D-39P04432 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 NPPCP23582 126 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 LCN12Q6JVE5 192 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 TRGV9Q99603 122 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 ASCL2Q99929 193 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 ERVK11-1P61568 191 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 MPV17L2Q567V2 206 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZSR3 168 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 IGLC2P0DOY2 106 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 IGLC3P0DOY3 106 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 BMPERQ8N8U9 685 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 CEP250Q9BV73 2442 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 DPM2O94777 84 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV1D-33P01593 117 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV1-33P01594 117 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 TCRAP04437 139 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 CACNG7P62955 275 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 C11orf52Q96A22 123 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 RNF125Q96EQ8 232 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FAM231BA6NCW3 169 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 WNT2P09544 360 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 LOXL3P58215 753 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZWC4 215 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 CD177Q8N6Q3 437 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 CCL3L1P16619 93 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 TM4SF20Q53R12 229 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 CT83Q5H943 113 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 C9orf172C9J069 976 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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