RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561204.5

MEIS3-211, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEIS3, Length 2,195 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-211ENST00000561204 PVRIGQ6DKI7 326 aa13.96□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 LINC00305Q7Z4B0 112 aa13.96□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 BAGE3Q86Y29 109 aa13.96□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 BAGE2Q86Y30 109 aa13.96□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 FAM168AQ92567 244 aa13.96□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 MOSP00540 346 aa13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 MT-ND6P03923 174 aa13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 RANP62826 216 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 WDR73Q6P4I2 378 aa13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 C19orf35Q6ZS72 473 aa13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 SPACA3Q8IXA5 215 aa13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 GNB4Q9HAV0 340 aa13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 SPTBN2O15020 2390 aa13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 PEX7O00628 323 aa13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 C1orf194Q5T5A4 169 aa13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 TEX45Q8NA69 505 aa13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 MISP3Q96FF7 219 aa13.95□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 DCHS1Q96JQ0 3298 aa13.94□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa13.94□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.94□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 IGLV1-47P01700 117 aa13.94□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 CRYGBP07316 175 aa13.94□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 APELAP0DMC3 54 aa13.94□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 MYCNOSP40205 109 aa13.94□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 RPL19P84098 196 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 TNFRSF19Q9NS68 423 aa13.94□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 POLEQ07864 2286 aa13.94□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 LYNX1G3V0Z9 82 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 LYNX1P0DP58 116 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 TNXAQ16473 311 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 KIAA1644Q3SXP7 199 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF600Q6ZNG1 722 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 TBX15Q96SF7 602 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 HSPB9Q9BQS6 159 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 B9A039 149 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 AMY1AP04745 511 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 ORM2P19652 201 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 COX19Q49B96 90 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 ETFRF1Q6IPR1 90 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 KIR2DL5AQ8N109 375 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 TNFRSF14Q92956 283 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 C2orf88Q9BSF0 95 aa13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 GNG5P63218 68 aa13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 MBD6Q96DN6 1003 aa13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 MUC6Q6W4X9 2439 aa13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 IZUMO1RA6ND01 250 aa13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 CD3EP07766 207 aa13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 CDKN1AP38936 164 aa13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF841Q6ZN19 808 aa13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 OR1B1Q8NGR6 318 aa13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 TRGV9Q99603 122 aa13.92□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa13.91□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa13.91□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa13.91□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 BMPR1BO00238 502 aa13.91□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 COMPP49747 757 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 CASP6P55212 293 aa13.91□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.91□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM116Q8NCL8 245 aa13.91□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 PERPQ96FX8 193 aa13.91□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.91□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 PRRX1P54821 245 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 OR10J3Q5JRS4 329 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 TOMM20LQ6UXN7 152 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 VKORC1Q9BQB6 163 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 INSIG2Q9Y5U4 225 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 HLA-DQA1P01909 254 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 RBPJQ06330 500 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 NUDT10Q8NFP7 164 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 STXBP6Q8NFX7 210 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 BLNKQ8WV28 456 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 NUDT11Q96G61 164 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 RCHY1Q96PM5 261 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 RNF114Q9Y508 228 aa13.9□□□□□ -0.18
MEIS3-211ENST00000561204 SRIP30626 198 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 BRS3P32247 399 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 FOXC1Q12948 553 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM183BQ1AE95 376 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 TDRG1Q3Y452 100 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 LINC01560Q8TB33 94 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 CLEC7AQ9BXN2 247 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 C7orf69Q9H7B7 122 aa13.89□□□□□ -0.19
MEIS3-211ENST00000561204 CBLN4Q9NTU7 201 aa13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms