RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555503.1

GPHN-208, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 3

Gene GPHN, Length 655 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-208ENST00000555503 RAB40CQ96S21 281 aa5.1□□□□□ -1.59
GPHN-208ENST00000555503 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
GPHN-208ENST00000555503 NDUFAF3Q9BU61 184 aa5.1□□□□□ -1.59
GPHN-208ENST00000555503 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.1□□□□□ -1.59
GPHN-208ENST00000555503 HINT2Q9BX68 163 aa5.1□□□□□ -1.59
GPHN-208ENST00000555503 DUSP21Q9H596 190 aa5.1□□□□□ -1.59
GPHN-208ENST00000555503 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.1□□□□□ -1.59
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GPHN-208ENST00000555503 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.09□□□□□ -1.59
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GPHN-208ENST00000555503 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
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GPHN-208ENST00000555503 TRAPPC2BP0DI82 140 aa5.06□□□□□ -1.6
GPHN-208ENST00000555503 PSMB9P28065 219 aa5.06□□□□□ -1.6
GPHN-208ENST00000555503 TAS2R31P59538 309 aa5.06□□□□□ -1.6
GPHN-208ENST00000555503 CATR1Q13166 79 aa5.06□□□□□ -1.6
GPHN-208ENST00000555503 KLK9Q2XQG4 91 aa5.06□□□□□ -1.6
GPHN-208ENST00000555503 OR11H2Q8NH07 326 aa5.06□□□□□ -1.6
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