RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF329Q86UD4 541 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 ATOH7Q8N100 152 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 NUDT10Q8NFP7 164 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 NUDT11Q96G61 164 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 PAXXQ9BUH6 204 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 CLEC7AQ9BXN2 247 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 PEX7O00628 323 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 IGHV1-46P01743 117 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 TNXAQ16473 311 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 TBR1Q16650 682 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 C10orf113Q5VZT2 155 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 LCN12Q6JVE5 192 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 C11orf42Q8N5U0 333 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 GRAMD2BQ96HH9 432 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 APOA2P02652 100 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 PATE2Q6UY27 113 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 hADV38S2A0JD32 116 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 NBL1P41271 181 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 MAJINQ3KP22 176 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRR27Q6MZM9 219 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 H0YJW9 148 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 SIAH2O43255 324 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 HSBP1O75506 76 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 NPIPB3Q92617 1050 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 ROS1P08922 2347 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 IGHV3-48P01763 117 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 LINC00312Q9Y6C7 94 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 NDUFB8O95169 186 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 SFTPCP11686 197 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 REG1BP48304 166 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 WT1-ASQ06250 92 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 PMCHL1Q16048 86 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 FXYD5Q96DB9 178 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 DYSFO75923 2080 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 HIGD1CA8MV81 97 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 BPIFB3P59826 476 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 RELQ04864 619 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZZEF1O43149 2961 aa14.96□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 A0A1W2PN81 502 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 M0R2Z0 102 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 FSTL3O95633 263 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMEM177Q53S58 311 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 TNFSF4P23510 183 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 TSPOP30536 169 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 CAMPP49913 170 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 GNG5P63218 68 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 C1orf185Q5T7R7 199 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 CGB1A6NKQ9 187 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 CORTO00230 105 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 OR2J3O76001 311 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLAUP00749 431 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 VWC2LB2RUY7 222 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM27E3Q08E93 113 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 Q56UQ5 140 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 TCF21O43680 179 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCL3L1P16619 93 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 MYCNOSP40205 109 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 OR8B2Q96RD0 313 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KL1-209ENST00000555009 THAP8Q8NA92 274 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms