RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548092.5

TRAFD1-204, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAFD1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-204ENST00000548092 HERV-K104P61576 105 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 PLGLB1Q02325 96 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 ARL16Q0P5N6 197 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 BATFQ16520 125 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 HIST3H3Q16695 136 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 VWC2Q2TAL6 325 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 COX19Q49B96 90 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 SPIN3Q5JUX0 258 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 RAET1LQ5VY80 246 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM42Q69YG0 159 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 PET117Q6UWS5 81 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 NIT1Q86X76 327 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 BATF2Q8N1L9 274 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM251Q8N6I4 163 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 GATSQ8NAP1 163 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 NECAP1Q8NC96 275 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 OR4C5Q8NGB2 326 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 RNF138Q8WVD3 245 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 ST8SIA1Q92185 356 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 RAB1CQ92928 201 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 LHX4Q969G2 390 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TOMM40LQ969M1 308 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 ADIPOR1Q96A54 375 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 PGAM5Q96HS1 289 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 KCNS1Q96KK3 526 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 DGAT2Q96PD7 388 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 GPER1Q99527 375 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 RSG1Q9BU20 258 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 SFXN3Q9BWM7 321 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TTTY12Q9BZ98 90 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 RTN4RQ9BZR6 473 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 CENPMQ9NSP4 180 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 BET1LQ9NYM9 111 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 CLN8Q9UBY8 286 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 SMPXQ9UHP9 88 aa3.37□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 PRSS47A8MTI9 375 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 H0YJW9 148 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 K7ERU9 68 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TIMM23O14925 209 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 PDE6DO43924 150 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 PDCD6O75340 191 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 NAPSAO96009 420 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 HLA-DRB1P01911 266 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 MT-ND6P03923 174 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 OR10J4P0C629 311 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 SRD5A2P31213 254 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 BIDP55957 195 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 CLDN15P56746 228 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 FBXW4P57775 412 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 FXYD4P59646 89 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 GNB1P62873 340 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 HBG1P69891 147 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 HBG2P69892 147 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM27E3Q08E93 113 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 PMCHL1Q16048 86 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 NNATQ16517 81 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 CST9LP1Q5W188 147 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 Q6ZN92 141 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF695Q8IW36 515 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 DEFB125Q8N687 156 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF709Q8N972 641 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 C11orf52Q96A22 123 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 STARD4Q96DR4 205 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 SFRP2Q96HF1 295 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TXN2Q99757 166 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 CITED1Q99966 193 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms